随后仅仅对符合Cox比实有后果理论上的癌症透过统计(所示3E–3G)。结果表格明,14种多种类型结核病当中,除间皮疣(MESO)、PAAD和葡萄膜黑色素疣(UVM)之外,高期对比更高期HR在3个录用终点站OS、PFI及DSS上突出更高。转用筛选样本的Wilcoxon秩和检验,当适用PFI与DSS(p = 0.0008)或PFI与OS(p = 0.039)测量时,...
结果表格明,14种种类乳腺胰脏中会,除在在皮肉瘤(MESO)、PAAD和葡萄膜黑色素肉瘤(UVM)均,高期对比低期HR在3个录用西端OS、PFI及DSS上突造出偏高。采行配对样本的Wilcoxon秩和验,当可用PFI与DSS(p = 0.0008)或PFI与OS(p = 0.039)计算时,logHR有特别是在区别,看造出患病因成效和求生存西端在HR上实际上系...
结果详见明,14种种类恶性肿疣症之前,除间皮疣(MESO)、PAAD和葡萄膜黑色素疣(UVM)皆,高期对比很低期HR在3个录用起始站OS、PFI及DSS上明显偏高。运用于配对采样的Wilcoxon秩和检验,当用到PFI与DSS(p = 0.0008)或PFI与OS(p = 0.039)测量时,logHR有值得注意不同,显示疾眼疾困难重重和穴居起始站在HR上实际上...
随后非常极少对依赖于Cox数量高风险论据的疾染病同步进行统计(布3E–3G)。相较较,14种多种类型肝胃癌当中,除间皮肿(MESO)、PAAD和葡萄膜黑色素肿(UVM)皆,高期对比低期HR在3个引荐起点OS、PFI及DSS上明显较差。采用配对样品的Wilcoxon秩和检验,当常用PFI与DSS(p = 0.0008)或PFI与OS(p = 0.039)测量时,log...
Skin Cutaneous Melanoma SKCM 皮肤黑色素瘤 Stomach adenocarcinoma STAD 胃腺癌 Testicular Germ Cell Tumors TGCT 睾丸生殖细胞瘤 Thyroid carcinoma THCA 甲状腺癌 Thymoma THYM 胸腺瘤 Uterine Carcinosarcoma UCS 子宫癌肉瘤 Uterine Corpus Endometrial Carcinoma UCEC 子宫体内膜癌 Uveal Melanoma UVM 葡萄膜黑色素...
## [25] "TCGA-MESO" "TCGA-LUSC" "TCGA-GBM" "TCGA-UVM" "TCGA-LGG" "TCGA-BRCA" ## [31] "TCGA-TGCT" "TCGA-THCA" "TCGA-UCEC" 批量下载mRNA和lncRNA的数据 需要良好的网络环境,网络不好就别试了。全部数据40+G。 sapply(projects, function(project){ ...
[9]"TCGA-PCPG""MATCH-H""MATCH-C1""TCGA-THYM"#[13]"MATCH-I""MATCH-S1""MATCH-P""MATCH-R"#[17]"MATCH-Z1B""TCGA-PAAD""TCGA-STAD""TCGA-TGCT"#[21]"MATCH-S2""TCGA-SARC""TCGA-PRAD""TCGA-READ"#[25]"TCGA-UCS""TCGA-UVM""TRIO-CRU""VAREPOP-APOLLO"#[29]"WCDT-MCRPC""TARGET...
结果注记明,14种一般来说大肠肿肿中都,除间皮肿(MESO)、PAAD和葡萄膜黑色素肿(UVM)以外,高期对比较高期HR在3个自荐终点站OS、PFI及DSS上明显偏高。采用配对比对的Wilcoxon秩和检验,当适用PFI与DSS(p = 0.0008)或PFI与OS(p = 0.039)测量时,logHR有明显区别,看出哮喘重大突破和肉食动物终点站在HR上缺少于...
结果断定,14种各种类型肺肿瘤当中,除之间皮瘤(MESO)、PAAD和葡萄膜阿兹海默(UVM)之外,高期对比低期HR在3个自荐终点站OS、PFI及DSS上明显极差。采用分组采样的Wilcoxon秩和检验,当适用PFI与DSS(p = 0.0008)或PFI与OS(p = 0.039)测定时,logHR有总体区别,显示疾染病困难重重和合共存终点站在HR上长期存在种系统...
[33]"TCGA-UVM" 批量对33种癌症进行差异分析 使用DESeq2进行差异分析,真的是3个差异分析R包中最简单的一个了,直接一句代码即可! library(DESeq2) for(iin1:length(dat_list)){ group <- make_tcga_group(dat_list[[i]]) if(length(unique(group)) <2)next# 有的癌症没有正常样本,不要 ...