TCGA官方链接: https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga 1. 什么是TCGA? TCGA,全称“The Cancer Genome Atlas”,即癌症基因组图谱。2006年开始,NCI(美国国家癌症研究所)和NHGRI(国家人类基因组研究所)合作建立癌症研究项目,汇集了来自不同学科和多个机构的顶级研究人员,...
TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库包含33种主要的癌症类型,包括肺癌、乳腺癌、结直肠癌、卵巢癌、前列腺癌、肝癌、胃癌、膀胱癌、肾癌、甲状腺癌、头颈癌、胰腺癌、皮肤癌(鳞状细胞癌和黑色素瘤)、脑胶质瘤、子宫内膜癌、食管癌、骨癌、睾丸癌、恶性胸膜间皮瘤、恶性周围神经鞘瘤、淋巴瘤、多发性骨髓瘤、胰腺神...
1.TCGA简介TCGA(The Cancer Genome Atlas)收集了大量癌症样本的数据,涉及33种不同癌症、超过 20000个样本,包括外显子组测序、RNA 测序、microRNA 测序、拷贝数变异、蛋白质组和甲基化组,临床信息等数据,研究者可以利用各种生物信息学工具和统计方法来挖掘数据中的有用信息,推动癌症研究的进展。 2.TCGAplot简介华科...
而事实上,这些文章都是TCGA的收官项目之作-泛癌症图谱(Pan-Cancer Atlas)的部分文章,泛癌症图谱总共包括27篇文章,一共可以分成3个部分,每个部分由一篇重磅Cell文章领头,其他的文章已经发表于CellPress旗下的其他著名期刊,比如Cancer Cell等杂志。 癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)想必早已为全世界广为...
TCGA(The cancer genome atlas,癌症基因组图谱)由 National Cancer Institute(NCI,美国国家癌症研究所) 和 National Human Genome Research Institute(NHGRI,美国国家人类基因组研究所)于 2006 年联合启动的项目, 收录了各种人类癌症(包括亚型在内的肿瘤)的临床数据,基因组变异,mRNA表达,miRNA表达,甲基化等数据,是癌症...
2006年,腺乳癌线粒体三幅谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)计划以多形连续性中空母线粒体肿(GBM)、呼吸系统粒状线粒体腺癌(LUSC)和卵巢浆液连续性囊腺腺癌(OV)开始年末末3年的试点项目,2009年~2015年年初展开。到项目月份,TCGA网络分析工作过者已描述了33种腺乳癌多种类型10,000余亦然得病征的分子会相似连...
TCGA,全称“The Cancer Genome Atlas”,即癌症基因组图谱。2006年开始,NCI(美国国家癌症研究所)和NHGRI(国家人类基因组研究所)合作建立癌症研究项目,汇集了来自不同学科和多个机构的顶级研究人员,正式开启了癌症基因组图谱计划。 TCGA目前数据库中收录了11,000个病人,33种癌症类型数据、拥有超过2.5PB的数据量,我们点击...
从本期开始,我们开始介绍TCGA (The Cancer Genome Atlas, 肿瘤基因组图谱) 数据库。TCGA是里程碑式的癌症基因组项目。相信很多人都听过或使用过TCGA数据库,网上也有非常多的关于TCGA介绍,利用该数据库的研究也不计其数。该数据库面向科学界和一般群众开放。
TCGA(The Cancer Genome Atlas)收集了大量癌症样本的数据,涉及33种不同癌症、超过 20000个样本,包括外显子组测序、RNA 测序、microRNA 测序、拷贝数变异、蛋白质组和甲基化组,临床信息等数据,研究者可以利用各种生物信息学工具和统计方法来挖掘数据中的有用信息,推动癌症研究的进展。
一、简介 TCGA(The cancer genome atlas,癌症基因组图谱)由 National Cancer Institute(NCI,美国国家癌症研究所) 和 National Human Genome Research Institute(NHGRI,美国国家人类基因组研究所)于 2006 年…