微阵列BRCA，COAD，GBM，KIRC，KIRP，LAML，LGG，LUAD，LUSC，OV，READ，UCECCEL（每个探针的原始信号...
...## 来源于 XENA 数据源: # https://gdc.xenahubs.net/download/TCGA-LAML/Xena_Matrices/TCGA-LAML.survival.tsv.gz...在Xena的survival.tsv中定义的结局事件是死亡,在TCGA-CDR中,PFI.1定义的终点事件是疾病进展,包括死亡、复发、转移等。...具体到病人TCGA-BA-5151,他可能是在术后517天发现有肿瘤...
汇总表格简写英文全称中文全称ACCAdrenocortical carcinoma肾上腺皮质癌BLCABladder Urothelial Carcinoma膀胱尿路上皮癌BRCABreast invasive carcinoma乳腺浸润癌CESCCervical squamous cell carcinoma and endoc…
# [21] "TCGA-OV" "TCGA-LUSC" "TCGA-LAML" "TCGA-LGG" "TCGA-SARC" "TCGA-BRCA" "TCGA-READ" "TCGA-LUAD" "TCGA-STAD" "TCGA-THCA" # [31] "TCGA-KIRC" "TCGA-SKCM" "TCGA-UCEC" projects %>% length # [1] 33 TCGA的33种癌症简写对应全称可在UCSC Xena查到. GDC Hub 查看一个项目...
LAML acute myeloid leukemia 急性髓性白血病 没有正常样本 TGCT testicular germ cell tumors 睾丸生殖细胞瘤 没有正常样本 MESO mesothelioma 间皮瘤 没有正常样本 UVM uveal melanoma 葡萄膜黑色素瘤 没有正常样本 UCS uterine carcinosarcoma 子宫癌肉瘤 没有正常样本 2.数据介绍 TCGA收录的了很全面的癌症基因组...
LAML Acute Myeloid Leukemia 急性髓细胞样白血病 LGG Brain Lower Grade Glioma 脑低级别胶质瘤 LIHC Liver hepatocellular carcinoma 肝细胞肝癌 LUAD Lung adenocarcinoma 肺腺癌 LUSC Lung squamous cell carcinoma 肺鳞癌 MESO Mesothelioma 间皮瘤 OV Ovarian serous cystadenocarcinoma 卵巢浆液性囊腺癌 PAAD Pancreati...
TCGA 全称为The Cancer GenomeAtlas Program ,即癌症基因图谱计划,是05 年时由美国发起一项用来研究癌症中基因组变化的计划。相较于GEO 数据库,基因数据更加规整,因此更具可信度,用来发文章影响因子也更高。 废话不多说,我们以结肠腺癌为例,来实战一番吧。
TCGA全称为The Cancer GenomeAtlas Program,即癌症基因图谱计划,是05年时由美国发起一项用来研究癌症中基因组变化的计划。相较于GEO数据库,基因数据更加规整,因此更具可信度,用来发文章影响因子也更高。 废话不多说,我们以结肠腺癌为例,来实战一番吧。
TCGA全称为The Cancer GenomeAtlas Program,即癌症基因图谱计划,是05年时由美国发起一项用来研究癌症中基因组变化的计划。相较于GEO数据库,基因数据更加规整,因此更具可信度,用来发文章影响因子也更高。 废话不多说,我们以结肠腺癌为例,来实战一番吧。