dbSNP全称为The Single Nucleotide Polymorphism Database,即单核苷酸多态性数据库,意思是“DNA序列中的单一碱基对(base pair)变异”,也就是DNA序列中A、T、C、G的改变,即基因组的一个特异和定位的位点出现两个或多个的核苷酸可能性,它是人类可遗传的变异中最常见的一种。该数据库是由NCBI与人类基因组研究所(Nat...
Expression and clinical significance of five major genes in cutaneous melanoma based on TCGA databaseCutaneous melanomaTCGAcBioPortalTarget genesEarly diagnosisTo explore the expression and clinical significance of major related genes in cutaneous melanoma based on the Cancer Genome Atlas (TCGA) datasets. ...
今天带来的这篇文章“Screening of Key Prognosis Genes of Lung Adenocarcinoma Basedon Expression Analysis on TCGA Database”是2022年12月发表在Journal of Oncology上的一篇生信文章,整体还是比较简单的,我们一起来看一下吧。 题目:“Screening of ...
再点击Download database 再点击human的GTF文件 下载Homo_sapiens.GRCh38.99.chr.gtf.gz文件 然后放到我们R语言的工作目录内，打开文件 gtf <- rtracklayer::import('Homo_sapiens.GRCh38.99.chr.gtf.gz')#转换为数据框gtf <- as.data.frame(gtf)查看文件，保存文件为Rdata，将来方便我们直接打开 dim(gtf)s...
(c) SND1 expression level in non-tumor (number, n = 50) and adjacent tumor tissues (n = 50) from liver cancer patients from the TCGA database. (d) SND1 expression level in non-tumor (n = 50) and all tumor tissues (n = 371) of liver cancer patients from the TCGA database. An...
Searching GDC database Downloading and preparing files for analysis Clinical data Mutation data Compilation of TCGA molecular subtypes Analyzing and visualizing TCGA data Case Studies Graphical User Interface (GUI) Classifiers TCGAbiolinks_Extension
题目:“Screening of Key Prognosis Genes of Lung Adenocarcinoma Based on Expression Analysis on TCGA Database” (基于TCGA数据库表达分析的肺腺癌关键预后基因筛选) 期刊:Journal of Oncology IF:4.501(2022年) 全文共5张图。 1.期刊介绍: 2.文章概要 ...
题目:“Screening of Key Prognosis Genes of Lung Adenocarcinoma Based on Expression Analysis on TCGA Database” (基于TCGA数据库表达分析的肺腺癌关键预后基因筛选) 期刊:Journal of Oncology IF:4.501(2022年) 全文共5张图。 1.期刊介绍: 2.文章概要 ...
2. http://www.oxfordjournals.org/nar/database/subcat/8/33 3.杨建,蔡浩洋.肿瘤生物信息学数据库.[J]生物技术通报,2015, 31(11):89-101 发表于:2018-10-30 原文链接:https://kuaibao.qq.com/s/20181030B1BCPX00?refer=cp_1026 腾讯「腾讯云开发者社区」是腾讯内容开放平台帐号(企鹅号)传播渠道之一,根...
基于ＴＣＧＡ数据库筛选乳腺癌相关预后基因及临床意义的探讨 张磊㊀陆进㊀宋文华㊀刘小五㊀刘飞㊀王晓丹㊀胡俊杰 ʌ摘要ɔ㊀目的㊀通过对ＴＣＧＡ数据库中乳腺癌高通量测序数据进行分析ꎬ寻找新的乳腺癌预后相关的基因ꎬ为后续研究提供数据支持ꎮ方法㊀收集ＴＣＧＡ数据库中１０６６例乳腺癌组织和...