如果发现BRCA1/2有突变,PARP抑制剂奥拉帕利也是一种选择。 子宫内膜癌的术后治疗以放疗、化疗、激素及靶向治疗为辅的综合治疗。但在既往40年里,晚期或复发性子宫内膜癌的生存率一直未有显著提高。而从2022年开始的免疫治疗数据正在改变子宫内膜癌的治疗方式。 其中在2023ASCO大会上公布了一项数据,GOG 258试验是一项...
一项包含36名子宫内膜癌患者的研究表明,在24%的病例中观察到HRD(同源重组修复缺陷),并且仅限于非子宫内膜样、TP53突变的子宫内膜癌(NEEC),主要属于高拷贝数型(CN-H型),除1例HRD病例外,其他所有病例均具有HRR基因的致病性BRCA1变异或高体细胞拷贝数(SCN)丢失。此评估可能有助于筛选铂类药物和PARP抑制剂的获益人群。
BRCA 乳腺癌 CESC 宫颈鳞状细胞癌 CHOL 胆癌 COAD 结肠癌 DLBC 淋巴癌 ESCA 食管癌 GBMLGG 脑癌 HNSC 头颈部鳞癌 KICH 嫌色细胞癌 KIRC 肾透明细胞癌 KIRP 乳头状肾细胞癌 LAML 骨髓癌 LIHC 肝癌 LUAD 肺腺癌 LUSC 肺鳞状细胞癌 MESO 胸膜癌 OV 卵巢癌 PAAD 胰腺癌 PCPG 肾上腺癌 PRAD 前列腺癌 READ ...
TP53突变型和TP53野生型BRCA病人的差异分析结果 https://mp.weixin.qq.com/s/Phu-MxA0d079HdtBWTHbWg 而且还有参考文章 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/354779v1 可以比较容易把自己的代码跟已经发表的研究进行比较,发现 immune gene-sets had significantly higher enrichment levels inTP53-mutated BC...
乳腺癌(BRCA):mRNA 表达数据最有效 结直肠癌(COADREAD):DNA 甲基化数据最佳 黑色素瘤(SKCM):突变数据最关键 这为临床研究人员提供了数据选择的最佳实践,帮助他们选择最有效的生物标志物,提高实验效率。 痛点4:缺乏公开可用的癌症分类工具 解决方法 研究团队发布了737 个高性能的癌症分类模型,所有模型均为公开资源...
marker基因差异表达与PAM50分型的热图:somatic突变图谱与PAM50分型 step1.数据下载 Agilent mRNA expression microarrays (n = 547)Affymetrix 6.0 single nucleotide polymorphism (SNP) arrays (n = 773)下载TCGA_xena中的BRCA数据：安捷伦芯片数据：AgilentG4502A_07_3 (n=597) TCGA hub 临床数据：Phenotypes (...
今天我们来聊聊如何用TCGAbiolinks包来下载乳腺癌(BRCA)的临床数据和表达矩阵数据。这些数据整理后,会包含特定基因的表达量、病人的年龄、TNM分期、三种激素受体的表达情况,以及PAM50分型等信息,非常适合后续的分析。 TCGAbiolinks包介绍 📦TCGAbiolinks是一个专为R语言设计的包,专门用于访问和分析The Cancer Genome ...
数据库中包含的20种肿瘤,我们可以点击每种肿瘤对应的柱状图,就可以查看对应癌种的数据啦。本文下面的内容主要以BRCA乳腺癌为例进行分析(包含1098个case)。 工作原理 (A) 显示了免疫基因组分析和用于分析的数据类型。结果保存在可通过网络访问的数据库中,即癌症免疫组图谱 (TCIA) ( https://tcia.at/ )。
在TCGA-BRCA数据中,基底样亚型中ENTPD1/NT5E表达与TANs浸润水平呈正相关(图4D)。从新鲜基底样乳腺癌手术标本(n = 6)和配对的外周血样本(n = 6)中纯化中性粒细胞。转录组分析显示,与外周血中性粒细胞相比,TANs具有更高的核苷酸酶ENTPD1和NT5E表达,与免疫抑制细胞招募相关细胞因子CCL2和CCL17的更高表达 (图...