TBtools 老用户基本都知道在哪里下载 最新版TBtools ,最开始是QQ群,后来 @CJ-陈程杰 老师都上传到奶牛快传,但是好多新用户还是一脸懵,不知道去哪里下载。最新版 TBtools 下载链接快速下载通道(奶牛快传): h…
获取途径 基因组文章中对应的链接 常见的数据库Ensemble植物,动物,PhytozomeNCBI 其他途径 1.1蛋白序列结合的整理与提取(TBtools) 1.1.1使用Gtf/Gff3 sequence extractor,基于基因结构注释信息,从基因组中提取出所有基因的CDS序列 image1.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png...
网址:https://github.com/CJ-Chen/TBtools 安装。 动手运行 2.3.2 提取序列 准备作物所有的蛋白序列文件(or基因文件) 目的基因的ID 打开TBtools,Fasta Extract or Filter (Qyick) 获得结果 2.4 目的同源基因motif分析 2.4.1 使用MEME进行motif预测 网址:https://meme-suite.org/meme/tools/meme 上传相关的fa文...
1 打开下列网址http://web.expasy.org/compute_pi/ 用tbtools转换格式 image.png 复制第二列序列数据到一个新文本文档onlyseq.txt,并把所有*删除 处理excel文件最后得到如下格式文件 image.png 2 motif分析及可视化MEME image.png 等待。。。 下载MAST xml文件 image.png 可以在线查看 MAST HTML output链接 image...
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共线性分析AI美化教程(新手向)#省流#批量选择#批量换色#零基础 03:06 【Tbtools】物种内目的基因共线性可视化完整教程#基因家族鉴定#省流 06:56 Excel利用VLOOKUP函数快速筛选多列数据#目的基因基因位置信息快速提取#共线性关系快速查找#省流 01:29 一图详细展示顺式作用元件#进化树&顺式作用元件可视化&气泡...
第一步，准备一个FASTA格式的示例文件，例如包含拟南芥所有AGO蛋白序列。第二步，启动TBtools。第三步，选择“Others >Phylogenetics > MUSCLE Wrapper”进行多序列比对。第四步，将示例文件拖入软件，设定保存路径与文件名，执行比对。第五步，选择“Others >Phylogenetics >trimAL Wrapper”对比对结果进行修剪...
首先，准备一个FASTA格式的示例文件，如拟南芥的所有AGO蛋白序列。接下来，启动TBtools。选择“Others >Phylogenetics > MUSCLE Wrapper”菜单进行多序列比对。将示例文件拖入指定框或直接从文件夹中选择，并输入保存路径及文件名，如“test.alignment.fasta”。点击“开始比对”。随后，选择“Others >...
步骤一:打开Tbtools并准备输入文件 📂 首先,打开Tbtools软件。在界面上,你会看到几个主要区域:输入文本框、Initialize按钮、输出文本框、待提取序列信息设置框以及可选参数设置框。 将你的Fasta文件拖入输入文本框中。这个文本框用来读取你的输入文件。 点击Initialize按钮进行初始化。这个步骤很关键,它会准备读取你的输...
这份教程,将会首先简单介绍界面组成,随后介绍分块功能(原名是 Amazing Optional Gene View,因为确实灵活),最后介绍全局组合。 功能界面介绍 TBtools 这个子工具的功能,比较稳健和丰富。可以先看看界面的主要组成。 待可视化的基因 ID 列表或者进化树,如果输入的是进化树,那么进化树也是有基因 ID 的,在程序逻辑上,跟 ...