TargetScan是一个广泛应用于基因调控研究的数据库,它主要用于预测和分析转录因子(TF)与靶基因之间的相互作用关系。以下是TargetScan数据库的主要特点: 高度可靠的预测算法:TargetScan数据库使用了一种基于保守性的预测算法,该算法结合了多种生物信息学方法,包括序列比对、序列特征分析和基因组学数据的整合等,从而提高了预测准
TargetScan数据库还广泛应用于生物信息学分析中。研究人员可以通过TargetScan预测miRNA的靶标基因,然后结合其他生物信息学工具,如基因功能富集分析、网络分析等,进一步揭示miRNA调控的生物学意义。例如,研究人员可以通过TargetScan预测某个miRNA的靶标基因,然后进行基因功能富集分析,从而揭示这些靶标基因参与的生物过程和通路。
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mer，其在分子生物学领域中意义为单体单元 （monomeric unit，mer）。通常用于核酸序列中的单位，代表nt或者bp，例如，100 mer DNA代表这段DNA序列单链长度100nt，或者双链长度100bp。而k-mer则是指将核酸序列分成包含k个碱基的字符串，即从一段连续的核酸序列中迭代地选取长度为K个碱基的序列，若核酸...
请问用targetscan预测miRNA靶基因,预测结果中sps值和Ta值两项代表什么,是越高越好还是越低越好? 扫码下载作业帮搜索答疑一搜即得 答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 TA (target site abundance) contributionSPS (seed-pairing stability) contribution这篇文献对这两个指标做了很详尽的说明其中图4d,很形象的把这...
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The first (seed) sequence was taken as a reference, and all other sequences were compared with it using Censor