TAPS(TET-assisted pyridine borane sequencing)是通过TET1氧化酶将5mC和5hmC氧化为5caC,然后被吡啶硼烷还原为二氢尿嘧啶(DHU)。随后被扩增生成了C转化为T的PCR产物。与BS-seq相比,TAPS是非破坏性的,具有更好的测序质量、比对率和覆盖率。基于酶学方法的...
TAPS 测序全称「TET-assisted pyridine borane sequencing」,可译为 TET 辅助吡啶硼烷测序。其中,TET(Ten-Eleven Translocation)指 10-11 转位酶,该酶能将 5-羟甲基胞嘧啶 氧化成 5-羟甲基胞嘧啶 等产物。 流程 用TET 酶将 或 氧化成第三种修饰 。 运用So...
(TET-assisted pyridine borane sequencing),该技术的核心为Bisulfite-free,同时利用将甲基化的C碱基转换为T碱基的方法。 5caC/5fC 偶遇 Pyridine borane 目前已有实验证明TET蛋白可以将5-甲基胞嘧啶(5mC)and 5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)氧化最终转换为 5-羧基胞嘧啶(5caC),在此基础上,作者通过MALDI技术发现5...
这个方法的特点在于它不是用亚硫酸氢盐(bisulfite)处理对DNA进行甲基化测序。 TAPS的英文全称是“TET-assisted pyridine borane sequencing”,翻译成中文,就是:“TET协助的吡啶硼烷测序”。 这其中,TET是“ten-eleven translocation”的缩写,指的是“10-11转位酶”。TET酶能够把甲基化的C碱基转化成羧基化的C碱基。
TAPS的英文全称是“TET-assisted pyridine borane sequencing”,翻译成中文,就是:“TET协助的吡啶硼烷测序”。 这其中,TET是“ten-eleven translocation”的缩写,指的是“10-11转位酶”。TET酶能够把甲基化的C碱基转化成羧基化的C碱基。 方法的原文,大家可以看这篇文章:《Bisulfite-free direct detection of5-methyl...