梗概 将Cellranger中的基因表达矩阵filtered_gene_bc_matrices用于分析。 进行质量控制(QC),以删除异常细胞; 标准化与归一化,消除技术噪音与批次效应; 主成分分析(PCA)与挑选 t-SNE聚类 参考网站:https://satijalab.org/seurat/pbmc3k_tutorial.html (注意!!!现在这个网站会自动跳转到3.0版本) Seurat的安装:R中...
除了新开工的3+1个项目,玄武区还将新开办长江路小学启迪分校、南京师范大学附属小学实验幼儿园红山新城第一分园;启动建设项目5个,计划总投资1.45亿元,总建筑面积约3万平方米,分别是:原址扩建项目2个,南京理工大学实验小学改扩建工程、宇花小学校园整体升级改造工程;改造项目3个,尖角营校区办园改造工程、逸仙小学附属...
将Cellranger中的filtered_gene_bc_matrices用于分析。 进行质量控制(QC),以删除异常细胞; 标准化与归一化,消除技术噪音与批次效应; 主成分分析(PCA)与挑选 t-SNE聚类 参考网站:https://satijalab.org/seurat/pbmc3k_tutorial.html 上次结果: 经过Cellranger的数据整理之后,得到: Filtered gene-barcode matrices MEX...
如果你的数据量过大，使用Seurat时内存不足，请看 实验记录11：海量scRNA-seq数据的质量控制、PCA、聚类