网址:TDNAscan: A Software to Identify Complete and Truncated T-DNA Insertions github:GitHub - BCH-RC/TDNAscan TDNAscan可以用于识别完整的和Truncated(被截短的)TDNA插入位点。A型和B型软剪切阅读用于识别正向T-DNA插入。D型和E型软剪切阅读用于鉴定反向T-DNA插入,而C型和F型不一致阅读用于鉴定插入,但不鉴...
网址:植保所开发T-LOC工具系统分析转基因作物插入位点-中国农业科学院植物保护研究所 上边有介绍,建议看看。 1.T-LOC下载安装 依赖:bwa,ShortRead git clone https://github.com/sfli001/T-LOC.git cd T-LOC/ chmod -R 777 . ./T-LOC.py 2.T-LOC使用示例 github或test/T-LOC.sh里都有示例 输入文...
以AD5的扩增效率最高,能扩增出80的T- DNA插入位点的侧翼序列.随机挑取哈茨木霉rr_DNA插入突变子 52个,选用引物AD5对DNA插入位点的 侧翼序列进行TAIL-PCR扩增并分析扩增序列发现,在获得的42条 侧翼序列中7条只含有质粒序列,33条对应着 单一的侧翼序列T-DNA,另外2条序列相同.34条T-DNA侧翼边界 序列中13条保存...
%的T-DNA插入位点的侧翼序列.随机挑取哈茨木霉T-DNA插入突变子52个,选用引物AD5对T-DNA插入位点的侧翼序列进行TAIL-PCR扩增并分析扩增序列发现,在获得的42条侧翼序列中7条只含有质粒序列,33条对应着单一的侧翼序列T-DNA,另外2条序列相同.34条T-DNA侧翼边界序列中13条保存着完整的右边界序列,21条T-DNA边界序列...
采用羧甲基纤维素钠筛选培养基,对黑曲霉(aspergillusniger)t-dna突变子文库进行筛选,分离到一株纤维素酶分泌水平较低的菌株an-108,为野生型菌株的83.3%。进一步测定该突变子固体发酵的纤维素酶活力,与野生型菌株相比没有明显差别,推测与固体发酵培养基中含有的天然糖类有关
广东农业科学 2014年第8期 柱花草炭疽菌突变体库致病缺陷转化子筛选 及T—DNA插入位点侧翼序列分析 高建明,胡彩平,郑金龙。,张世清,陈河龙,刘巧莲,习金根,易克贤, (1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室, 海南海口571101;2.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所...
[目的]利用农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)T-DNA系统,建立转化黑曲霉(Aspergillus,niger)分生孢子的方法,构建T-DNA插入突变子文库,为黑曲霉基因组功能注释研究打下基础.[方法]采用携带二元质粒载体pCAMBIA1301的农杆菌EHA105,诱导转化黑曲霉分生孢子,筛选具有潮霉素抗性的突变子.分析抗性稳定突变子菌株的表型,采用...
1. 稻瘟菌若干T-DNA插入突变体初步分析 2. 稻瘟菌T-DNA插入所致Pi9致病突变体的获得 3. 稻曲病菌T-DNA插入突变体5062的插入位点分析 4. 拟南芥At2g23470基因T-DNA插入突变体的鉴定 5. 烟草T-DNA插入位点侧翼序列扩增方法的筛选与优化 6. 稻曲病菌 T-DNA 插入突变体 B2510的插入位点分析 7. ...
农杆菌介导转化黑曲霉分生孢子及产孢缺陷突变子T-DNA插入位点分析 Wen Huang,Hongjiang Yang,Huibin Qin,黄文,杨洪江,秦慧彬 Keywords: Keywords: Aspergillus niger conidiospores,Agrobacterium tumefaciens mediated transformation,T-DNA,Inverse PCR关键词:黑曲霉分生孢子,农杆菌介导转化,T-DNA,反向PCR Full-Text...
利用不同的限制酶处理突变体的总DNA、电泳;并与野生型的处理结果对比,得到图所示放射性检测结果。(注:T-DNA上没有所用限制酶的酶切位点)对该实验的分析错误的是() A.检测结果时使用了放射性标记的T-DNA片段做探针 B.该突变体产生的根本原因是由于T-DNA插入到水稻核DNA中...