解析 答:确定拟南芥基因组T-DNA插入位点的试验操作如下: (1)提取拟南芥基因组; (2)PCR法和Southern法检测突变体T-DNA插入; (3)采用Tail-PCR方法扩增突变体T-DNA插入位点的侧翼序列; (4)DNAstar软件分析,得到相应的测序结果,分析T-DNA边界剪切位点,与拟南芥基因组数据库比对,确定T-DNA的插入位点。
解析 【解析】采用CTAB法提取拟南芥基因组,突变体T-DNA插人采用PCR法和Southem法检测,用TAILPCR扩增参试突变体T-DNA插入位点的侧翼序列,用DNAstmr软件分析取得的测序资料,分析T-DNA边界剪切位点,通过与拟南芥基因组数据库进行比对,即可确定T-DNA的插入位点。
解析 采用CTAB法提取拟南芥基因组,突变体 T-DNA插入采用 PCR 法和 Southem法检测,用TAIL-PCR 扩增参试突变体 T-DNA 插入位点的侧翼序列,用 DNAstar 软件分析取得的测序资料,分析T-DNA边界剪切位点,通过与拟南芥基因组数据库进行比对,即可确定T-DNA的插入位点。
网址:TDNAscan: A Software to Identify Complete and Truncated T-DNA Insertions github:GitHub - BCH-RC/TDNAscan TDNAscan可以用于识别完整的和Truncated(被截短的)TDNA插入位点。A型和B型软剪切阅读用于识别正向T-DNA插入。D型和E型软剪切阅读用于鉴定反向T-DNA插入,而C型和F型不一致阅读用于鉴定插入,但不鉴...
百度试题 题目7.如何确定拟南芥基因组T-DNA插入的位点?相关知识点: 试题来源: 解析反馈 收藏
回归正题,基因编辑过的作物会有载体序列插入到植物基因组中,确定T-DNA插入位点有重要用处,原理可以看一下这篇文章Illumina Sequencing Technology as a Method of Identifying T-DNA Insertion Loci in Activation-TaggedArabidopsis thalianaPlants。下面介绍我是如何完成这项工作的,有些内容比如软件安装和参数设置,网上已...
优选地,本发明所述的高效快速分离t-dna插入位点侧翼序列的方法中,所述步骤1)中提取基因组dna的方法为ctab法。 优选地,本发明所述的高效快速分离t-dna插入位点侧翼序列的方法中,所述步骤2)中基因组dna片段化的方法为超声破碎法。 优选地,本发明所述的高效快速分离t-dna插入位点侧翼序列的方法中,所述步骤2)中dn...
如何确定拟南芥基因组tdna插入的位点 用t-dna特异性引物和基因组特异性引物进行PCR扩增后测序即可确定。 CDNA与基因组DNA有何区别? 一、来源不同CDNA:CDNA是以mRNA为模板,在适当引物的存在下,由mRNA经过反转录而得到的DNA,是mRNA链 T-DNA可随机插入植物基因组内,导致被插入基因发生突变。用... (1)顶芽 生长素...
IPCR确定T-DNA突变体插入位点 IPCR是克隆插入片段侧翼序列非常有效的方法。IPCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色体序列,这时选择的引物虽然与核心DNA区两末端序列互补,但两引物3’端是相互反向的,其目的在于扩增一段已知序列旁侧的DNA。先提取筛选后得到的T-DNA插入突变体植物基因组DNA,选择T-DNA插入标签中...