sce_T <- RunUMAP(sce_T,dims = 1:15) } table(sce_T$RNA_snn_res.0.8) sel.clust <- "RNA_snn_res.0.8" DefaultAssay(sce_T) <- "RNA" Ⅲ T细胞亚群细分 选择了0.5和0.8的阈值进行可视化,检查其中的Marker基因list,用于后续的细胞亚群注释 ### step5:手动命名单细胞亚群 --- ### 自定义一...
这些细胞被命名为初始细胞(N)、中央记忆细胞(CM)、效应记忆细胞(EM)和重新表达CD45RA的终末分化效应记忆细胞(TEMRA),尽管体内也可能存在一些中间亚群。 除了这些标记物,CD27和CD28可进一步将T细胞亚群细分如下: •N(CCR7+、CD27++、CD28++、CD4...
通过CCR7和CD45RA,T细胞可分为四个主要亚群。这些细胞被命名为初始细胞(N)、中央记忆细胞(CM)、效应记忆细胞(EM)和重新表达CD45RA的终末分化效应记忆细胞(TEMRA),尽管体内也可能存在一些中间亚群。 除了这些标记物,CD27和CD28可进一步将T细胞亚群细分如下: •N(CCR7+、CD27++、CD28++、CD45RA+)•CM(CCR7+...
T细胞分类方法有多种:按细胞表面分化抗原 (CD)的不同,可分为CD4+和CD8+两大亚群;按T细胞表面受体 (TCR)的不同,可分为αβT细胞γδT细胞;按功能可分为辅助性T细胞 (Th 细胞)、抑制性T细胞 (Ts细胞)、细胞毒T细胞 (CTL或Tc细胞)和迟发型超敏反应T细胞 (TDTH细胞);按对抗原应答的不同,分为初始T细胞 (...
辅助T细分亚群及其记忆状态、活化、增殖等分析逻辑 第一个图,主要是分出总单核、总B、总NK、总DC、γδT细胞。然后分出总的CD4+T和CD8+T,以便后面进一步细分。 第二个图,主要是根据CD45RA和CCR7,分出4个象限,这4个象限的群体,根据CD95和CD28的表达,依次往下分出Tscm、TN、、TCM、TTM、TEM、TTE等。另外...
现在是雪貂支气管肺泡灌洗液单细胞转录组显示SARS-CoV-2感染期间巨噬细胞的顺序变化专辑第2讲:主要是对 NK cells and CD8+T 进行细分亚群 下面是前年实习生(日行一膳)的分享1643459432584 本次复现的是于2021年7月27日发表在Nature Communications上的”Single-cell transcriptome of bronchoalveolar lavage fluid reve...
T细胞分类方法有多种:按细胞表面分化抗原 (CD)的不同,可分为CD4+和CD8+两大亚群;按T细胞表面受体 (TCR)的不同,可分为αβT细胞γδT细胞;按功能可分为辅助性T细胞 (Th 细胞)、抑制性T细胞 (Ts细胞)、细胞毒T细胞 (CTL或Tc细胞)和迟发型超敏反应T细胞 (TDTH细胞);按对抗原应答的不同,分为初始T细胞 (...
辅助T细分亚群及其记忆状态、活化、增殖等分析逻辑 第一个图,主要是分出总单核、总B、总NK、总DC、γδT细胞。然后分出总的CD4+T和CD8+T,以便后面进一步细分。 第二个图,主要是根据CD45RA和CCR7,分出4个象限,这4个象限的群体,根据CD95和CD28的表达,依次往下分出Tscm、TN、、TCM、TTM、TEM、TTE等。另外...