SWISS-PROT是经过注释的蛋白质序列数据库,由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护。数据库由蛋白质序列条目构成,每个条目包含蛋白质序列、引用文献信息、分类学信息、注释等,注释中包括蛋白质的功能、转录后修饰、特殊位点和区域、二级结构、四级结构、与其它序列的相似性、序列残缺与疾病的关系、序列变异体和冲突等信息。
Swiss-Prot数据库是一个高质量、手工注释的蛋白质序列数据库,它与其他数据库相互补充,共同构成了Swiss-Prot蛋白质注释系统。 Swiss-Prot注释结果包括以下几个方面: 1.蛋白质序列比对:通过比对目标序列与Swiss-Prot数据库中的已知蛋白质序列,找出最相似的序列,为研究者提供目标序列的可能来源。 2.功能注释:根据比对...
Swiss-Prot蛋白质序列数据库,英文名称:Swiss-Prot Protein Sequence Database,由欧洲分子生物学实验室主持建立的蛋白质序列数据库。研究 SWISS-PROT中尽可能减少了冗余序列,并与其它30多个数据建立了交叉引用,其中包括核酸序列库、蛋白质序列库和蛋白质结构库等。SWISS-PROT数据库包含了EMBL核酸序列数据库中被经过...
Swiss-Prot蛋白质序列数据库,英文名称:Swiss-Prot Protein Sequence Database,由欧洲分子生物学实验室主持建立的蛋白质序列数据库。 折叠编辑本段研究 SWISS-PR360百科OT中尽可能减少了冗余序列,并与其它30多个数据建立了交叉引用,其明毛中包括核酸序列库、蛋白质序列库和蛋白质结构库等。SWISS-PROT数据库包含了EMBL核...
Swiss-Prot注释结果的主要内容包括序列注释、功能注释、结构注释、域注释、修饰注释等。序列注释提供了蛋白质序列的基本信息,如其长度、氨基酸组成、亚细胞定位、跨膜结构等。功能注释是对蛋白质功能的描述和解释,包括其在细胞中的作用、与其他分子的相互作用以及参与的代谢途径等。结构注释提供了蛋白质的三维结构信息,可...
首先,Swiss-Prot的注释结果提供了关于蛋白质序列的详细信息。它列出了蛋白质的氨基酸序列,并提供了该序列的长度、分子量、理论等电点和等等。这些信息对于研究者来说非常有用,可以帮助他们更好地了解蛋白质基本的组成和性质。 其次,Swiss-Prot的注释结果还包含了蛋白质的功能信息。它提供了详细的描述,说明了蛋白质在...
SWISS-PROT是一个由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的蛋白质序列数据库,以注释信息丰富著称。其包含蛋白质序列及其相关条目,包括序列、引用文献、分类学信息和注释等。注释部分详尽介绍了蛋白质的功能、转录后修饰、特殊位点和区域、二级与四级结构、序列相似性、与疾病关联、序列变异体和冲突等关键信息。
一、Swiss-Prot (一)Uniprot简介 Uniprot (Universal Protein )是包含蛋白质序列,功能信息,研究论文索引的蛋白质数据库,整合了包括EBI( European Bioinformatics Institute),SIB(the Swiss Institute of Bioinformatics),PIR(Protein Information Resource)三大数据库的资源。
SWISS-PROT数据库中的序列数据与蛋白质前体对应,用户可通过特征表提供的信息推断成熟蛋白质或多肽序列。特征表包括跨膜螺旋、配体结合位点、翻译后修饰位点等超二级结构单元的注释。序列数据格式便于计算机软件查询,通过对每行起始的标识字建立索引文件,用户可以方便地找到所需字段。SWISS-PROT数据库的这种...