Swiss-Prot数据库是一个高质量、手工注释的蛋白质序列数据库,它与其他数据库相互补充,共同构成了Swiss-Prot蛋白质注释系统。 Swiss-Prot注释结果包括以下几个方面: 1.蛋白质序列比对:通过比对目标序列与Swiss-Prot数据库中的已知蛋白质序列,找出最相似的序列,为研究者提供目标序列的可能来源。 2.功能注释:根据比对...
Swiss-Prot注释结果的主要内容包括序列注释、功能注释、结构注释、域注释、修饰注释等。序列注释提供了蛋白质序列的基本信息,如其长度、氨基酸组成、亚细胞定位、跨膜结构等。功能注释是对蛋白质功能的描述和解释,包括其在细胞中的作用、与其他分子的相互作用以及参与的代谢途径等。结构注释提供了蛋白质的三维结构信息,可...
(4)研究人员直接提交的蛋白质序列数据。 哪两个部分 答:(1)SP-TrEMBL(SWISS-PROT TrEMBL):包含最终将要集成到SWISS-PROT的数据,所有的SP-TrEMBL序列都已被赋予SWISS-PROT的登录号。 (2)REM-TrEMBL(REMaining TrEMBL):包括所有不准备放入SWISS-PROT的数据,因此这部分数据都没有登录号。反馈...
SWISS-PROT数据库中的序列数据与蛋白质前体对应，用户可通过特征表提供的信息推断成熟蛋白质或多肽序列。特征表包括跨膜螺旋、配体结合位点、翻译后修饰位点等超二级结构单元的注释。序列数据格式便于计算机软件查询，通过对每行起始的标识字建立索引文件，用户可以方便地找到所需字段。SWISS-PROT数据库的这种结...
SWISS-PROT是一个由欧洲生物信息学研究所（EBI）维护的蛋白质序列数据库，以注释信息丰富著称。其包含蛋白质序列及其相关条目，包括序列、引用文献、分类学信息和注释等。注释部分详尽介绍了蛋白质的功能、转录后修饰、特殊位点和区域、二级与四级结构、序列相似性、与疾病关联、序列变异体和冲突等关键信息。
首先,Swiss-Prot的注释结果提供了关于蛋白质序列的详细信息。它列出了蛋白质的氨基酸序列,并提供了该序列的长度、分子量、理论等电点和等等。这些信息对于研究者来说非常有用,可以帮助他们更好地了解蛋白质基本的组成和性质。 其次,Swiss-Prot的注释结果还包含了蛋白质的功能信息。它提供了详细的描述,说明了蛋白质在...
Swiss-Prot ( http://www.expasy.org/sprot )是一个蛋白质序列数据库。 Biopython能够解析纯文本的Swiss-Prot文件, 这种格式也被Swiss-Prot、TrEMBL和PIRPSD的UniProt数据库使用。然而我们并不支持UniProKB的XML格式文件。10.1.1 解析 Swiss-Prot 记录在5.3.2 章节中, 我们描述过怎样将一个 Swiss-Prot记录中的...
Within the UniProt consortium, the UniProtKB/Swiss-Prot knowledge base provides the international community with a stable, comprehensive, fully classified, richly and accurately annotated protein sequence database that is fully operable with other databases. Annotation relates to function(s) of the ...
SWISS-PROT是一个详尽的蛋白质序列数据库，由欧洲生物信息学中心（EBI）维护，并已合并入UniProt数据库。该数据库旨在为基因组和蛋白质组的研究提供最新且详细的蛋白质氨基酸序列信息。SWISS-PROT中尽可能减少冗余序列，并与多个数据库建立了交叉引用，包括核酸序列库、蛋白质序列库和蛋白质结构库。这些数据...
一、SWISS-PROT蛋白质序列库的特点：SWISS-PROT由EMBL核苷酸序列库翻译而来，附件TrEMBL数据库含有126,995...