方法如下：1、访问Swiss-Model官网，提交蛋白质分子的序列，选择合适的模板，并进行建模。2、在qualityassessment页面，点击ledstructure选项卡，找到Ramachandranplot。3、Ramachandranplot会显示氨基酸残基的二面角分布，X轴和Y轴分别代表phi和psi二面角。4、红线表示四面体角区域，绿线表示左扭区域，黄线表示右扭...
１）打开SWISS-MODEL官网，点击Start Modelling；２）将我们准备好的氨基酸序列粘贴进指定窗口，序列自动识...
（1）利用Swiss-model网站在线对目的序列三级结构进行预测，提交后，下载生成的pdb文件。利用PDB数据库（h...
(1)首先看搜到的模板与你的序列一致度是否>30%,如果不大于,要发英文文章此结果就应放弃,用iTASSER重新预测。如果只是看看,发中文或放进毕业论文,20%以上也可继续做。 (2)如果可用,再看swissmodel自带的评分高低。 GMQE :可信度范围为 0-1,值越大表明质量越好 QMEAN4:区间-4-0,越接近0,评估待测蛋白与模...
3.提交到uclq-doe进行检测,Procheck 得的Ramachandran 94.4%在最适区，5.6%较适区能看懂，其他的...
选中三个活性位点，调整背景色，突出活性位点，添加标签。保存图片或复制至word文档。进行同源蛋白结构比对，调整背景颜色、突出活性位点。分析盐桥数量，使用ESBRI或VMD软件。在线提交序列，使用PIC网站分析氢键、Cation-pi、Aromatic、Hydrophobic相互作用。保存结果至excel表格。构建发育树，添加文本框对比蛋白分类...
蛋白质三级结构预测图见附件Word，稍微有懂得帮忙看一下，万分感谢。
1、可靠性：Swiss-Model是经过广泛验证和评估的蛋白质模型预测软件。基于多种算法和技术，包括比对、模拟和评估等，能够提供准确可靠的蛋白质结构预测结果。这一些算法和技术已经在许多研究中得到验证，并被科学界广泛接受。2、应用广泛：Swiss-Model在结构生物学和蛋白质研究领域有着广泛的应用。可以帮助科研...
打开SWISS-MODEL网站:http://swissmodel.expasy/,选择“TemplateIdentification,提交蛋白质序列进行模板识别,如图所示,注意:邮箱必填,名称随便填写,序列粘贴过去就行,下面会有很多选项,建议不知道的不要乱动,直接提交(Sbumit)吧。这个东东跟BLAST差不多,你等它自动刷新吧,它会返回结果的,在结果页面,你会看到跟BLAST差...