在同源建模预测蛋白质三维结构（SWISS-MODEL与Pymol的零基础教程）中，我们首先通过在线Swiss-model预测目标蛋白的三级结构，下载pdb文件，并从PDB数据库中找到同源蛋白结构。接着，使用Pymol软件处理pdb文件，通过设置颜色和标签，突出显示活性位点。对比分析时，我们打开多个同源序列，调整为球棍模型，并进行...
进行同源蛋白结构比对，调整背景颜色、突出活性位点。分析盐桥数量，使用ESBRI或VMD软件。在线提交序列，使用PIC网站分析氢键、Cation-pi、Aromatic、Hydrophobic相互作用。保存结果至excel表格。构建发育树，添加文本框对比蛋白分类。利用Phyre网站预测3D结构，调整Fancy Helices。保存或复制图片。进行溶剂可及表面图...
百度试题 题目【单选题】下列不属于蛋白质 - 蛋白质相互作用数据库 A. BIND B. Intract C. DIP D. Swiss-model相关知识点: 试题来源: 解析 Swiss-model 反馈 收藏
PM 14:00~14:50十. 基于能量的相互作用机理分析 教学目标:从能量角度出发,分析分子间、残基间、重要基团间相互作用机理,对实验提供理论指导12 能量分析 12.1 残基分解(相互作用分析) 12.2 丙氨酸扫描(寻找热点残基) 12.3 氢键网络(其它相互作用) PM 15:00~15:50十一. 经典工作复现 教学目标:引导初学者了解本方...
建模器, I-TASSER, LOMETS, SWISS-MODEL, SWISS- MODEL 存储库, Robetta,... 结合位点预测 MED-SuMo, TRAPP, CAVER, sc-PDB, CASTp, Pocketome, 3DLigandSite, metaPocket, PockDrug,... 对接 Autodock, DOCK, GOLD, SwissDock, DockingServer, 1-ClickDocking,... 筛选 Pharmer, 催化剂, PharmaGist,...