（1）利用Swiss-model网站在线对目的序列三级结构进行预测，提交后，下载生成的pdb文件。利用PDB数据库（http://www.rcsb.org/）下载同源序列的pdb文件。PDB数据库：点击Sequences，在新页面右侧粘贴同源蛋白的氨基酸序列。根据相似度结果下载得到pdb格式的同源序列结构文件。（2）Pymol软件打开预测后的
https://www.youtube.com/watch?v=W2Sy3ZUjE88&ab_channel=SIB-SwissInstituteofBioinformatics刚开始学生信,翻得不好,请大家不吝赐教, 视频播放量 12870、弹幕量 2、点赞数 259、投硬币枚数 71、收藏人数 813、转发人数 128, 视频作者 奇古菌, 作者简介 随缘搬运视频,随
将所有的序列黏贴后回到SWISS-MODEL的网站,在下图框框里面输入氨基酸序列 这里只选了BRCA1蛋白质的前60个氨基酸,黏贴后点击“build model” 最后,等着邮件收结果。
SWISS-MODEL同源建模的方法 SWISS-MODEL同源建模简介 SWISS-MODEL是一个自动化的蛋白质比较建模服务器，该服务器提供用户三种模式可选择：Automaticmode（简捷模式）:用于建模的氨基酸序列或是Swiss-Prot/TrEMBL(http://www.expasy.org/sprot)编目号（accession）可以直接通过web界面提交。服务器会...
swiss—model的使用 SWISS-MODEL 同源建模的方法 ;SWISS-MODEL同源建模简介; SWISS-MODEL网页界面;填写正确的邮箱,会有邮件;提交以后会出现;反馈的结果也可以在myWorkspace?中查看,自己的邮箱是用户名,邮件里边有password? ;可以把结果保存下来;;;预测的三维结构; SWISS-MODEL网页界面;;;接着会出现下面的界面;出现...
SWISS-MODEL的官网地址:https://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html。蛋白质组学分析,包括蛋白质一级结构,二级结构,三级结构,亲疏水性,磷酸化位点,理化性质以及蛋白互作分析等。如果需要基因家族分析,转录组学分析,蛋白质组学分析,可将需求及分析对象发送至
SWISS-MODEL是常用的蛋白二级结构预测在线工具,我们只需上传蛋白序列就可以预测得到蛋白的3D结构。 当然,SWISS-MODEL也可以对蛋白的3D结构进行可视化,除了选择不同的着色方案,也可以选择不同的结构模型样式,比如Cartoon、Tube、Trace、Lines、Ball+Stick等,例如选择Cartoon后的渲染效果如下。
在Pymol软件中打开预测序列pdb文件，设置Helix、Sheet、Loop颜色。选中三个活性位点，调整背景色，突出活性位点，添加标签。保存图片或复制至word文档。进行同源蛋白结构比对，调整背景颜色、突出活性位点。分析盐桥数量，使用ESBRI或VMD软件。在线提交序列，使用PIC网站分析氢键、Cation-pi、Aromatic、Hydrophobic...
在搜索栏中输入"swissmod 官方网站"进行搜索。在搜索结果中找到SWISSMODEL的官方网站，通常这是最可靠的信息来源。在官网上，找到下载区域，通常会有适合您设备的安装程序或链接。确认软件版本，选择合适的下载选项。下载完成后，根据指示进行安装，可能需要阅读并接受许可协议，然后按照向导的步骤进行操作。安...
Uniport网址:https://www.uniprot.org/ SWISS-MODEL:https://swissmodel.expasy.org/ 【拉氏图生成】 PROCHECK@ UCLA-DOE LAB(推荐):https://saves.mbi.ucla.edu/ PROCHECK@ EBI-PDBSum(典中典):http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/pdbsum/Generate.html 展开更多...