常用的数据库是swiss-model和interproscan。 同源蛋白模型构建(模建)的步骤: ① 目标蛋白序列与目标序列的匹配:应用 FASTA 或 BLAST 搜索软件,在 PIR 、 SWISSPROT 或 GENEBANK 等序列库中按序列同源性挑选出一些同源性比较高的序列,然后把挑选出的序列与目标序列基序多重匹配,得到模板结构等价位点套的初始集合。
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常用的数据库是swiss-model和interproscan。 同源蛋白模型构建(模建)的步骤: ① 目标蛋白序列与目标序列的匹配:应用 FASTA 或 BLAST 搜索软件,在 PIR 、 SWISSPROT 或 GENEBANK 等序列库中按序列同源性挑选出一些同源性比较高的序列,然后把挑选出的序列与目标序列基序多重匹配,得到模板结构等价位点...
摘要: 蛋白质的三级结构预测可通过同源建模、Threading和TOPITS等方法进行,但同源建模是应用最为广泛 的方法。SWISS—MODEL正是一个基于同源建模的蛋白质结构服务器。它与ExPASy网站和DeepView程序是紧 密相联系的。该文重点介绍SWISS—MODEL的提交方式、建模 ... ...
蛋白质的三级结构预测可通过同源建模,反向折叠和从头预测等方法进行,但同源建模是应用最为广泛的方法.SWISS-MODEL是一个免费的蛋白质同源模建服务器.通过对比多个与μ阿片受体同属G蛋白偶联受体的视紫红质蛋白序列,选择以同源性最高的牛视紫红质蛋白1F88为模板,基于SWISS-M...
同源模建的可靠程度在于你是否能找到合适的模板,如果目标蛋白和模板蛋白的序列一致性大于30%,其结果还是...
指定模板的地方只能指定一个模板啊,怎么办,求助啊 还只能指定一条链,怎么会这样 [Last edited by ...
残基的静电力和分子表面携带的最小自由能。g.对序列已知结构未 知的蛋白质,Deep View 会将氨基酸序列递交给ExPASY , 通过找 到同源序列进行比对,将比对结果通过ExPASY 递交给Swiss Model,做出同源模型。二.Getting Started 载入一个蛋白质分子的方法有以下几种 a.可以直接在菜单file→open PDB file b.也...
指定模板的地方只能指定一个模板啊,怎么办,求助啊 还只能指定一条链,怎么会这样 [Last edited by ...