代码语言:R 复制 ctrl <- rfeControl(functions = svmFuncs, method = "cv", number = 10) 运行SVM-RFE算法:使用rfe函数运行SVM-RFE算法,传入特征矩阵和目标变量,以及之前创建的控制参数对象。 代码语言:R 复制 result <- rfe(x = features, y = target, sizes = c(1:10), rfeControl = ctrl) 查看...
设置参数少,只需要输入有分类信息的基因表达数据,代码将自行执行序列后向选择算法,对每个特征进行得分进行排序并输出格式为CSV表格,同时还可以绘制特征的真实值和错误率变化曲线图。 使用方法: Rscript SVMRFE.R -input= 参数说明: USAGE: SVMRFE.R-input= PARAMETERS: -inputthe expression data,the first column ...
Step1:输入数据并构建SVM-RFE模型 Step2:训练svm分类器和交叉验证 Step3:计算错误率和准确率并绘图 下面是代码中附带数据逐步分析结果: svm-error图 svm-accuracy图 神奇吧,就是如此简单,我们用的都是入门级函数,稍微懂点R语言就能实现。 通过SVM-...
svm-error图 svm-accuracy图 神奇吧,就是如此简单,我们用的都是入门级函数,稍微懂点R语言就能实现。 通过SVM-RFE筛选出目标基因之后,我们还可以进行预后模型构建、免疫肿瘤微环境和免疫细胞相关性分析等,想做免疫分析的可以扫码关注我们。 如需代码及示例数据等文件,请扫码聊天框回复 “B24”领取!
SAS这个软件，本身其实是包罗万象的。现在大家喜欢说我会用SAS，其实都是托大了。就好像说我会R一样。
RFEr语言代码 RFE(Recursive Feature Elimination)是一种特征选择的算法,可以用于选择数据集中对预测目标最具有影响力的特征。在R语言中,我们可以使用一些库来实现RFE算法,如caret和rfe。 下面是实现RFE算法的步骤: | 步骤 | 描述 | | --- | --- | | 1 | 导入必要的库 | | 2 | 加载数据 | | 3 | ...
基于R语言e1071包在SVM模型中使用递归特征消除法(RFE)筛选出的最优的特征模型 上传者:weixin_42676678时间:2021-10-02 Ttest-RFE-SVM.rar_RFE算法_SVM-RFE_dna microarray_matlab ttest_svm 对DNA微阵列用RFE-SVM算法对基因进行分类 上传者:weixin_42651887时间:2022-07-14 ...
本文首发于GZ号:R语言小站 如需复制代码建议移步,GZ号内代码是以代码框输入,复制更准确 如何用SVM-RFE筛选变量与在临床研究中的应用 摘要 在临床研究中,识别与疾病发展相关的关键生物因子对于理解病理机制、早期诊断和治疗策略的制定至关重要。支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)是一种结合了支持向量机(SVM)分类能力...
本代码使用svm_RFE来循环递归式的对数据特征进行排序,从而筛选出有用的特征,同时可以看到特征排序,已经每次筛选出去的特征点赞(0) 踩踩(0) 反馈 所需:1 积分 电信网络下载 blbyu 2021-11-24 03:16:34 评论 没有一点用 simmalysmile 2020-12-22 23:28:46 评论 下载下来,用什么软件打开?
Xorshift32算法是一种伪随机数生成算法,可以在R语言中实现。下面是一个示例代码: 代码语言:txt 复制 # Xorshift32算法实现 xorshift32 <- function(seed) { state <- as.integer(seed) next <- function() { state <<- bitwXor(state, bitwShiftL(state, 13)) ...