该结果图片为通过LASSO回归和SVM-REF算法进行特征选择,最后取两种方法得到的16个交叉基因作为特征基因的Venn图。 最终小云顺利完成了利用 lassso回归和SVM-REF两种机器学习算法进行了特征基因筛选,机器学习相关其他分析内容欢迎尝试本公司新开发的云平台生物信息分析小工具,零代码完成分析,云平台网址:http://www.biocloud...
5.3feature_lasso.csv 该结果是基于Lasso算法经过特征选择,筛选出的特征基因。 6.4feature_svm.csv 该结果是基于SVM-REF算法经过特征选择,筛选出的特征基因,FeatureName表示基因名。 7.7C_lasso_SVM_venn.pdf 该结果图片为通过LASSO回归和SVM-REF算法进行特征选择,最后取两种方法得到的16个交叉基因作为特征基因的Venn图...
利用R语言进行SVM..利用R语言进行SVM-REF分析,筛选基因,需要多长时间,我这样会有结果吗,input基因差异表达表格,然后分成了对照组和实验组,直接运行了这个svmREF代码,然后一直回报一个参数,一直回报,不知道
基于SVM的基因选择(SVM-RFE算法)[SVM Recursive Feature Elimination (SVM RFE)] 基因选择算法SVM-RFE http://www./thread-11568-1-1.html 基于平均影响值MIV的SVM变量筛选方法 http://www./thread-11569-1-1.html 基于SVM的语音特征信号分类 http://www./thread-11821-1-1.html 如何可视化libsvm的分类结果...
svm.csv,行名为样本名,第一列为分组信息,其他列为基因所对应的表达矩阵。 4.LASSO回归和SVM-REF筛选特征变量 train <- read.csv("svm.csv",row.names = 1, as.is = F) #后面svmRFE函数要求group的类型为factor dim(train) train[1:4,1:4] ...
最终小果顺利完成了利用 lassso回归和SVM-REF两种机器学习算法进行了特征基因筛选,小伙伴们多多理解代码的意义哦~ 往期推荐 1.搭建生信分析流水线,如工厂一样24小时运转Snakemake——进阶命令 2.比blast还优秀的序列比对工具?HMMER来了 3.对单细胞分析毫无头绪?让popsicleR领你入门 ...
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