// Validate the sampled suffix array values are correctvoidSampledSuffixArray::validate(conststd::stringfilename,constBWT* pBWT) { ReadTable* pRT =newReadTable(filename);SuffixArray* pSA =newSuffixArray(pRT,1);std::cout<<"Validating sampled suffix array entries\n";for(size_ti =0; i < p...
我发现这idx.sort一步很慢.我认为它很慢,因为Python需要通过值而不是指针传递子串(如上面的C代码). 测试文件可以从这里… c python suffix-tree suffix-array programming-pearls Han*_*Sun 2012 11-26 11推荐指数 3解决办法 4811查看次数 勘误表在关于后缀数组的原始论文中? 我正在看原始论文图3中给出的...
suffixArray.Load( fileNameSuffix ); }// do something with itif(stdioFlag) {while(true) {stringquery;if(getline(cin, query,'\n').eof()) {//...这里部分代码省略...
否则,A<B⟺rk[a]<rk[c]。不同子串的数目考虑子串就是后缀的前缀,若我们按照后缀排序的顺序,从 sa[i−1] 到sa[i] 时,重复的前缀数量就是 lcp(sa[i],sa[i−1]) ,也就是 height[i] 。这个结论比较显然就不证明了。容斥一下,答案即为 n(n+1)2−∑i=2nheight[i]。
利用排序后的后缀数组(suffix array)来求解最长公共子串步骤为: 一,拼接文本串和模式串得到一个新的串X; 二,将X的所有后缀数组存入sa;(文本串长度为m,模式串长n。步骤二时间复杂度o(m+n) 三,对sa进行排序; 四,计算sa中相邻的子串的最长公共前缀长度(时间复杂度o((m+n)*Min(m,n))) ...
芯片磨标,法力无边。 Suffix array finding unique substrings 发布于 2024-03-02 18:23・IP 属地上海 玄学 C / C++ 编程语言 写下你的评论... 打开知乎App 在「我的页」右上角打开扫一扫 其他扫码方式:微信 下载知乎App 开通机构号 无障碍模式 ...
后缀数组(suffix array)详解 简介:写在前面 在字符串处理当中,后缀树和后缀数组都是非常有力的工具。 其中后缀树大家了解得比较多,关于后缀数组则很少见于国内的资料。 其实后缀数组是后缀树的一个非常精巧的替代品,它比后缀树容易编程实现, 能够实现后缀树的很多功能而时间复杂度也不太逊色,并且,它比后缀树所占用...
struct SuffixArray { struct RadixElement { int id, k[2]; } RE[MAXL], RT[MAXL]; int N, A[MAXL], SA[MAXL], Rank[MAXL], Height[MAXL], C[MAXL]; void RadixSort() { int i, y; for (y = 1; y >= 0; y--) {
// C++ program for building suffix array of a given text #include <iostream> #include <cstring> #include <algorithm> using namespace std; const int N = 1e5 + 5; int c[N] = {0}; // Structure to store information of a suffix struct suffix { int index; // To store original index...
* C++ Program to Implement Suffix Array */ #include <iostream> #include <cstdlib> #include <cstring> #include <string> usingnamespacestd; classSuffixArray { private: string*text; intlength; int*index; string*suffix; public: SuffixArray(string text) ...