STRING是一个用于检索已知蛋白和预测蛋白之间相互作用的数据库，包含实验数据、来源于PubMed的结果、其他数据库的数据以及利用生物信息学的方法预测的结果，信息全面可靠，是研究蛋白质功能和互作的重要工具。进入官网（https://cn.string-db.org/），目前数据库已收录12535个物种，59.3million个蛋白，大于20billion种互...
STRING 是一个广泛使用的数据库和资源,主要用于预测和可视化蛋白质-蛋白质相互作用网络。它结合了实验数据、计算预测以及已知的生物学知识来预测蛋白质相互作用。 数据来源: STRING 的数据来源包括实验验证的相互作用、计算预测的相互作用、文献挖掘以及来自其他数据库的信息。 功能: ● 提供蛋白质之间的直接(物理)和间...
STRING数据库(https://string-db.org/)是一个在线搜索已知的蛋白互作关系的数据库,目前已经更新到10.5版本,共存储了2031个物种,9643763种蛋白,1380838440个相互作用的信息。 STRING数据库可以输入蛋白质名称或者蛋白质序列进行查询,需要注意的是,如果我们输入的是单个蛋白质名称...
protein-mode 该模式中,string数据库能够预测到特定物种中的某一个蛋白质的相互作用关系 通过该模式可以获取最多的特异性,但是覆盖面就会较小一些,原因是该模式中,string不会准确的去获取其他物种的直系同源物,取而代之的是通过序列中的相似性搜索来估计直系同源 简单来说,物种间的相互作用关系信息的传递是基于“deg...
String数据库是一个可以用来检索已知蛋白和预测蛋白之间相互作用的数据库。除了可以对这些蛋白生成精美的蛋白质-蛋白质-互相作用(PPI)图,还提供了输入蛋白的的分析,包括常见的功能富集分析(GO、KEGG),参考出版物等。 String数据库主要包含以下功能: Network
STRING数据库(https://string-db.org/)是一个在线搜索已知的蛋白互作关系的数据库,功能非常强大,能够构建PPI网络,也能链接到其他重要的数据库。这是之前生物信息的一个作业,分享给有需要的人,希望能有所帮助~知识分享官 知识 科学科普 科普 String数据库 String数据库介绍 生物信息学 打卡挑战...
一.首先针对缓存介绍redis缓存数据库。 1.redis缓存数据库个人理解介绍 1.1.redis缓存数据库是开源免费,是一个高性能的key-value结构的数据库,同时还提供list、set、zset、hash等数据结构的存储;string类型是redis最基本的类型,string类型是二进制安全的,也就是说redis的string类型可以包括任何对象(包括.jpg图片对象),...
STRING 提供应用程序编程接口（API），允许开发者在不使用图形用户界面的情况下访问数据库信息。API 适用于需要以编程方式访问特定数据，或在网页中集成 STRING 网络的情况。目前通过 HTTP 实现，允许通过 HTTP 请求访问数据库信息。注意，为防止服务器过载，API 方法在每个查询中允许访问的蛋白质数量有限。...
表1.String增强命令 命令 语法 说明 CAS CAS key oldvalue newvalue CAS(Compare And Set),查看目标key的value是否等于一个指定的值,如果相等,则将value修改为一个新的值;不相等则不修改。 说明 该命令仅适用于操作Redis String类型的数据,如需对TairString做相同的操作,请使用EXCAS。