STRING是一个用于检索已知蛋白和预测蛋白之间相互作用的数据库，包含实验数据、来源于PubMed的结果、其他数据库的数据以及利用生物信息学的方法预测的结果，信息全面可靠，是研究蛋白质功能和互作的重要工具。进入官网（https://cn.string-db.org/），目前数据库已收录12535个物种，59.3million个蛋白，大于20billion种互...
STRING数据库(https://string-db.org/)是一个在线搜索已知的蛋白互作关系的数据库,目前已经更新到10.5版本,共存储了2031个物种,9643763种蛋白,1380838440个相互作用的信息。 STRING数据库可以输入蛋白质名称或者蛋白质序列进行查询,需要注意的是,如果我们输入的是单个蛋白质名称...
[网址名称]:STRING [网址链接]:https://www.string-db.org/ 网站的数据也是可以下载的,点击Download,网站所有的后台数据,包括蛋白互作数据,蛋白附件数据,完整的数据库存储。 当然,你也可以下载某一物种的,如人类,输入物种名称,点击UPDATE,即可出现相应的数据,点击即可下载。 教程讲解 这里以多个差异基因的分析进行示...
STRING 是一个广泛使用的数据库和资源,主要用于预测和可视化蛋白质-蛋白质相互作用网络。它结合了实验数据、计算预测以及已知的生物学知识来预测蛋白质相互作用。 数据来源: STRING 的数据来源包括实验验证的相互作用、计算预测的相互作用、文献挖掘以及来自其他数据库的信息。 功能: ● 提供蛋白质之间的直接(物理)和间...
STRING数据库(https://string-db.org/)是一个在线搜索已知的蛋白互作关系的数据库,功能非常强大,能够构建PPI网络,也能链接到其他重要的数据库。 这是之前生物信息的一个作业,分享给有需要的人,希望能有所帮助~ 知识 科学科普 科普 String数据库 String数据库介绍 ...
该页面选择性提供数据库数据 完整的string数据库提供付费下载(学院免费) Protein mode:protein模式的数据 COG mode:COG模式的数据 General flatfiles &full database sumps:通用信息数据(物种、别名等) 用户说明文档(user documenttation) 开始-相互昨天网络-蛋白质窗口-FAQ-使用情景介绍 ...
STRING 提供应用程序编程接口（API），允许开发者在不使用图形用户界面的情况下访问数据库信息。API 适用于需要以编程方式访问特定数据，或在网页中集成 STRING 网络的情况。目前通过 HTTP 实现，允许通过 HTTP 请求访问数据库信息。注意，为防止服务器过载，API 方法在每个查询中允许访问的蛋白质数量有限。...
我们目前使用HTTP提供一个实现,其中数据库信息是由HTTP请求访问的。由于实现的原因,类似于web站点,一些API方法只允许在每个查询中使用有限数量的蛋白质。如果您需要访问批量数据,您可以从下载页面下载整个 数据集string-db.org/cgi/download.pl STRING API: ...
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