在Cell上发表研究成果，利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，构建了全球首份多器官衰老时空图谱，增强了对衰老生物学机制的理解，找到了可用于衰老预警和评估的新型生物学标志物，并为进一步探索衰老的干预策略奠定了理论基础。
Stereo-seq技术能同时“拍到”组织里每个细胞的基因信息和空间位置，其使用的芯片是研究人员基于华大自主研发的DNBSEQ测序技术研制的具有空间位置信息的、阵列式排布的DNA纳米球空间捕获芯片。该芯片可以实现超高精度和超大视野的生命分子成像，其分辨率可达500纳米（单个细胞可被400个像素点捕获），实现亚细胞定位。同时，该...
空间转录组 | 华大Stereo-seq在植物科学中的应用 Stereo-seq是空间组学技术研究中最有力的技术之一,基于DNB纳米球(DNB)技术构建。这种方法允许以前所未有的(纳米级)分辨率对组织切片进行高通量转录组分析,其面积可扩展至厘米级,具有高灵敏度和同质捕获率。通过整合高通量转录组学、蛋白质组学和组织学染色数据,可以...
4月29日，2024中关村论坛年会“重大成果专场发布会”于北京举行，面向全球重磅发布了一批重大原创成果、重磅创新政策、最新研究报告，持续打造全球前沿科技和未来产业的“风向标”。华大时空组学技术Stereo-seq作为“面向人民生命健康”的重大科技成果之一入选并发布。华大时空组学技术Stereo-seq入选重大科技成果。华大集团供...
CellBin基于华大时空芯片底层设计,利用track线实现1μm内配准精度,将细胞影像图和表达矩阵对齐;利用影像学特征完成高精度的组织分割、细胞核分割以及细胞内分子归类,刻画出单个细胞的分子边界;映射到芯片内,提取分子信息,获得精准的单细胞表达矩阵。 图1 CellBin工作原理及核心算法 a.CellBin工作流程,包含配准、组织分割...
很有客户只做了华大的空间转录组,分析起来就有点麻烦,注释成了老大难,这种情况下, 图像识别(分割)获取单细胞级别的空间数据,成了最优解。 首先我们来看一下华大数据的矩阵格式,其中的一些基础内容大家自己多多查阅,这里就不多介绍了。 同时我们还需要拿到tiff的图片文件,一般都有很多张 ...
2021年1月19日,深圳华大生命科学研究院联合国内外多机构共同开发的全新空间转录组测序技术:Stereo-seq对外发布,该技术以前所未有的(亚细胞级)分辨率对组织切片进行高通量转录组分析,区域可扩展到厘米级,具有高灵敏度和均匀的捕获率。相关研究内容已经在BioRxiv上进行了预印刊载。
近日,杭州华大生命科学研究院联合吉林大学、中国科学院分子细胞科学卓越创新中心、广州医科大学第五附属医院、山西医科大学等机构,利用华大自主研发的高分辨的时空组学技术Stereo-seq,以及高通量单细胞转录组测序技术DNBelab C4,绘制了小鼠肝脏稳态-2/3切除-再生模型的时空转录图谱。该研究在全肝叶尺度解析了稳态与再生状态...
杭州华大生命科学研究院、深圳华大生命科学研究院联合广东省医学科学院、华南师范大学、武汉大学等多家科研单位,利用华大自主研发的高分辨率时空组学技术Stereo-seq,绘制了首个蝾螈端脑发育及再生的时空单细胞转录组图谱,鉴定了蝾螈端脑再生过程中...