文章主要研究了胎盘发育过程中滋养层细胞侵入的调控机制,并通过研究大鼠、小鼠和猪作为生物医学模型,利用scRNA-seq单细胞测序技术阐明了胎盘滋养层细胞侵入的调控机制,并结合人类子痫前期(PE)疾病模型使用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq进行了验证。研究发现了一种具有免疫特征的滋养层细胞(iTrophoblast),它只存在于...
Stereo-seq技术的核心在于独特的DNA纳米球(DNB)阵列芯片,这个创新设计突破了传统技术在分辨率、基因捕获和视野上的局限。Stereo-seq芯片拥有单细胞级分辨率以及13 cm×13 cm超大捕获面积,可满足研究人员精确匹配目标组织大小,实现从时间和空间维度对生命发育、肿瘤演化、脑科学再生研究中的基因和细胞变化过程进行超高精度解...
值得一提的是,Stereo-seq方法学文章,不到两年时间内,被引用次数达到559。 其中,2022年发表在Nature上的一篇述评,引用小鼠胚胎发育时空图谱研究文章,指出Stereo-seq可对单细胞测序技术在研究中缺失的细胞空间位置信息进行补充。Stereo-seq“更高的空间分辨率”和“更广的转录组覆盖范围”的技术特点,也可以更好地应对绘...
第二十六节:scRNA-seq和bulk RNA-seq数据联合分析推断细胞类群互作网络【Cell】 第二十七节:scATAC-seq分析Sequence motif enrichment and Transcription factor footprinting 【Nat Genet】 第二十八节:以Nature文章为例系统讲解scRNA-seq与scATA...
发布了头条文章:《华大Stereo-seq系列成果发布,揭秘超高分辨率生命景时空图谱》 国际顶级期刊Cell和子刊Developmental Cell,上线了4篇应用Stereo-seq技术的研究文章,揭示其在小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥等模式生物中的应用成果,其中Cell文章详细介绍了Stereo-seq技术原理和细节。 °华大Stereo-seq系列成果发布,揭秘超高分辨率...
通过单细胞(scRNA-seq)和时空转录组(scStereo-seq)研究,首次解析迄今为止跨时间点最广(GW6-GW23)、面积最大(最大4cm x 3cm)的人脑多区域时空发育转录组图谱,为解码人脑发育及区域特化研究提供了新见解。安诺优达为本研究合作作者,承担scRNA-seq、Stereo-seq实验、测序、基础分析等服务。(图1)今天小编来为大家...
Stereo-seq简介 Stereo-seq(spatial enhanced resolution omics-sequencing)技术基于DNB(DNA nanoball)阵列芯片和原位捕获技术研发的具有更高分辨率的空间转录组技术。技术原理如下: Generation of Stereo chips:合成随机的25nt序列作为空间坐标barcode (coordinate identity,CID),以及5 '磷酸化的DNB文库oligo序列,并链接在...
单细胞空间转录组测序(Stereo-seq),就像给细胞装GPS+录音笔📡!不仅能听见每个细胞的"基因悄悄话",还能定位它在组织里的精确坐标!传统测序是"细胞大锅饭",而它能做出"细胞满汉全席", 视频播放量 2、弹幕量 0、点赞数 1、投硬币枚数 0
案例一:Stereo-seq助力绘制全球首个非人灵长类全脑皮层空间单细胞3D图谱 基于大尺寸芯片的Stereo-seq在猕猴大脑研究中展现了显著优势。以2023年7月发表在Cell上的文章[4]为例,研究人员选择两只猕猴的整个大脑皮层进行单细胞转录组研究,并利用三只成年雄性猕猴的左半球10 mm冠状切片进行了Stereo-seq分析。利用5cm×3cm...
2022年5月,华大生命科学研究院在 Cell发表了Stereo-seq方法学文章,截至目前,该文章被引用次数已达559次。 空间组学是生命科学领域近年来最热门的技术之一。继2020年被 Nature Methods评为年度技术方法之后,202…