stat_ellipse函数stat_ellipse函数 stat_ellipse函数是R语言中的一个统计学函数,用于计算和绘制数据集中的椭圆形。它可用于数据可视化和分析中,特别是在多元分析和聚类分析中,可以帮助我们更好地理解数据分布和变量之间的关系。该函数可以根据数据的均值和协方差矩阵计算出椭圆的参数,并将其绘制在散点图或密度图上。
在ggplot2中,stat_ellipse函数用于绘制椭圆形轮廓,geom_point函数用于绘制散点图。要为stat_ellipse函数绘制的轮廓填充颜色,可以通过fill参数进行设置。fill参数接受一个颜色值或颜色向量,用于指定填充颜色。 下面是一个完整的例子,展示如何使用stat_ellipse函数绘制轮廓并填充颜色: 代码语言:txt 复制 library(gg...
stat_ellipse 是ggplot2 包中的一个统计变换函数,用于在散点图上绘制椭圆。这些椭圆可以表示数据的置信区间或数据分布的密度区域。在二维空间中,stat_ellipse 通常用于表示数据点的分布范围,特别是在聚类分析或主成分分析(PCA)的结果展示中。 2. 置信区间的概念 置信区间是一种统计方法,用于估计某个未知参数(如均值...
在ggplot中使用stat_ellipse函数时,有时会出现覆盖ggplot中aes项的情况。为了防止这种情况发生,可以采取以下措施: 1. 确保正确设置aes项:在ggplot函数中,aes项用...
置信区间的添加一般是添加95%置信度水平上的置信区间，这里使用stat_ellipse函数进行添加，这也是常用的一...
ellipse path line polyline polygon text tspan textPath animate animateMotion animateTransform 自定义组件 自定义组件的基本用法 数据传递与处理 继承样式 slot插槽 生命周期定义 动态创建组件 数据类型说明 组件参考(兼容JS的类Web开发范式-ArkUI.Lite) 框架说明 文件组织 ...
(dis_bray, k = nrow(otu) -1, eig = TRUE, add = TRUE)# 提取 PCoA 样方得分(坐标)# Extract PCoA sample scores (coordinates)pcoa_site <- pcoa$point# db-RDA,环境变量与 PCoA 轴的多元回归# db-RDA, multiple regression of environmental variables and PCoA axes# 通过 vegan 包的 RDA 函数 ...
stat_function(fun = exp, geom = "line") # 画e^x在(0, 2)区间的函数图形,数据点由插值产生 ggplot(data.frame(x = c(-5, 5)), aes(x)) + stat_function(fun = dnorm) # 画在区间(-5, 5)区间的正态分布密度图,数据点由插值产生 ...
ellipse:是否画出95%置信区间。 xlim1:PCA score plot的X轴边界。 ylim1:PCA score plot的Y轴边界。 HeatMap HeatMap是用来做热图的函数,使用的是R中的pheatmap函数。使用方法如下: HeatMap(met.data, log.scale = FALSE, color = c("palegreen", "firebrick1", "royalblue"), ...
("#74add1","#a60026"))+ #添加置信区间,两种选一个就行 #add confidence intervals #stat_ellipse(linetype = 1,level = 0.95,aes(group = Treatment, color = Treatment)) + #stat_chull(geom = 'polygon', aes(group = Treatment, color = Treatment, fill = Treatment), alpha = 0.1) + ...