R语言中一个方便的工具包是ggpubr,其中的stat_compare_means函数可以用来比较不同组别的均值。本文将介绍如何使用stat_compare_means进行均值比较,并提供一个简单的示例供大家参考。 准备工作 在使用stat_compare_means之前,首先需要安装并加载ggpubr包。如果你还没有安装这个包,可以使用以下代码安装: install.packages...
在R语言中,stat_compare_means函数是一个非常有用的函数,用于进行两个或多个组的均值比较的假设检验。这个函数是ggpubr包的一部分,它提供了一种可视化方式来展示统计结果。以下是如何使用stat_compare_means函数进行假设检验和结果比较的步骤: 安装和加载ggpubr包首先,你需要安装并加载ggpubr包。你可以使用以下代码...
R中ggpubr包中stat_compare_means函数method的默认值是什么 r软件numeric函数,1.数据管理numeric:数值型向量logical:逻辑型向量character;字符型向量list:列表data.frame:数据框c:连接为向量或列表√length:求长度subset:求子集 √seq,from:to,sequen
今天练习了使用ggpubr包ggboxplot()和stat_compare_means()函数绘制带有显著性P值的差异箱线图。 参考资料: 【R语言绘图】差异表达箱线图(含显著性计算) https://mp.weixin.qq.com/s/tO6ko0c7P56k5BARjDejIQ 成果如下: 绘制该图的语法代码以及详细注释语句(比参考资料中的代码更少,更容易操作理解),我都...
据说可以直接赢得主编的好感。此包就是ggpubr，一个联合ggplot2包进行绘图工具包。首先看下包的安装：...
你肯跟会说用t检验，不过t检验一定是正确的吗？是否方差齐性，是否正态分布，这些都是我们要关心的，...
根据method函数选择统计方法,多组时候可选anova ,两组时候可根据情况选择t.test 或者 wilcox.test . 2, 指定ref组 比如想把所有的细胞类型都和un进行比较 , 可以通过ref.group 进行设置 p1 + stat_compare_means(method = "wilcox.test", ref.group = "un") ...
Needed to add (aes(group = condition) inside stat_compare_means. p <- ggboxplot(df, x = "ID", y = "value", color = "condition", palette = "jco",add = "jitter")+ facet_wrap(~family,scales='free_x')+ scale_y_continuous(labels = comma)+ stat_compare_means(aes(group = c...
I have the following plot and want to want to compare HER2+ to triple-negative for each gene (41BB, CD8A, ...) using ggpubr's stat_compare_means. In the end I want to have 6 p-values, one over each gene. Is that possible currently with g...