简单重复序列(Simple Sequence Repeat, SSR),又称微卫星序列,指基因组中由1-6个核苷酸组成的串联重复序列,如CACACA……,广泛分布在各种真核生物基因组中。 原理: 微卫星的突变率在不同物种、同一物种的不同位点或同一位点的不同等位基因...
一、简介: SSR简单序列重复标记(Simple sequence repeat, 简称SSR标记),也叫微卫星序列重复,是由一类由几个核苷酸(1-5个)为重复单位组成的长达几十个核苷酸的重复序列,长度较短,广泛分布在染色体上。由于重复单位的次数的不同或重复程度的不完全相同,造 一、简介: SSR简单序列重复标记(Simple sequence repeat, 简...
“利用简单重复序列SSR进行基因定位”,最早出现在2019年北京朝阳的一模试题中: 没想到,2024年河北的遗传高考题就第一次出现了,非常具有典型特征。 简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR),也称为微卫星DNA(Microsatellite DNA),是一类广...
-g GENOME, --genome GENOME Fatsa genome, should include all sequences from genome file. -c CHR, --chr CHR Chromosome name, should be in the format of chr1A,chr2A,chr3A...(default is all chromosomes). -t THREADS, --threads THREADS The number of threads (default is 1). Example: py...
SSR(simple sequence repeat )技术是另一种非常有用的分子标记技术,在生物体基因组内存在许多重复的简单序列小片断,在不同种内小片断的重复数不同,这种不同的重复数,是由其遗传基因所决定,有种属特异性,这种差异经PCR扩增后,被放大到可检测程度。因此SSR构成 ...
SSR(Simple Sequence Repeats)标记是近年来发展起来的一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术，也称为微卫星DNA(MicrosatelliteDNA),是一类由几个核苷酸（一般为1~6个）为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列。每个SSR两侧的序列一般是相对保守的单拷贝序列。特点：与其它分子标记相比，SSR标记具有...
简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR) 简单重复序(SSR)也称微卫星DNA,其串联重复的核心序列为1一6 bp,其中最常见是双核苷酸重复,即(CA) n和(TG) n每个微卫星DNA的核心序列结构相同,重复单位数目10一60个,其高度多态性主要来源于串联数目的不同。SSR标记的基本原理:根据微卫星序列两端互补序列设计引物,通过...
SSR(Simple Sequence Repeats ) 又称微卫星 DNA,是一类由几个(多为 1~6 个) 碱基组成的基序 (motif )串联重复而成的 DNA 序列,其长度一般较短,它们广泛分布于整个基因组的不同位置上,每个座 位上重复单位的数目及重复单位的序列都可能不完全相同,因而造成了每个座位上的多态性。SSR 标记数 量丰富,覆盖整个...
微卫星标记(microsatellite),又称为短串联重复序列(short tandem repeats,STR)或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成。由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富,因此微卫星标记的应用非常广泛。微卫星位点通常通过PCR...
微卫星DNA又叫简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR),指的是基因组中由1-6个核苷酸组成的基本单位重复多次构成的一段DNA,广泛分布于基因组的不同位置,长度一般在200 bp以下。研究表明,微卫星在真核生物的基因组中的含量非常丰富,而且常常是随机分布于核DNA中。在植物中通过对拟南芥、玉米、水稻、小麦等的研究...