SSR检测是一种基于简单重复序列的DNA分子标记技术,通过PCR扩增特定区域,并对扩增产物进行电泳检测,能够有效区分不同个体或品系。SSR分子标记具有高多态性、共显性和广泛分布于基因组的特点,广泛应用于遗传多样性分析、构建遗传连锁图谱、标记辅助选择育种等领域。其操作流程包括样品准备、引物设计与筛选、PCR扩增、电泳检测...
四、阅微重要农作物 SSR panel检测服务 自2014 年农业部联合各地重点农作物农科院、研究所、农林科学院等单位起草几个主要粮食作物的品种鉴定SSR 检测行业标准,根据该标准,阅微基因开发了检测作物SSR 的 panel。该 panel 采用荧光 PCR 扩增(Quantitive Fluorescent PCR,QF-PCR)结合毛细管电泳检测的方法,进行扩增片段...
种子SSR检测的基本步骤包括DNA提取、SSR引物筛选、PCR扩增、电泳分析和数据解读和分析。其中,DNA提取是种子SSR检测的第一步,通常使用化学方法(如CTAB法)来破碎种子细胞并释放DNA。接下来,选择具有多态性的SSR引物用于PCR扩增,以产生目标位点的DNA片段。利用选...
SSR检测，即简单重复序列检测，是广泛存在于真核生物基因组中的简单重复序列。这类序列通常通过PCR扩增和电泳技术进行检测，然后依据片段大小区分等位基因进行分析。扩增后的等位微卫星则可以通过多种方法进行检测。传统的检测方法包括使用聚丙烯酰胺凝胶电泳结合放射显影或银染，但这往往耗时耗力且效率低下。阅...
与SSR相比,SNP则具有其独特的优势:SNP在全基因组中密度高、代表性强、遗传稳定性好;SNP标记是二等位基因,代表基因组中最小的遗传变异单元,数据统计简单、准确;SNP的检测方法灵活多样,易实现自动化。 众多研究表明,在现阶段的分子育种中,应继续发挥SSR 技术优势,同时积极推进结合SNP检测技术,在不同检测项目发挥更积...
SSR检测服务 SSR是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列,通过特异性引物进行PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳和放射自显影,就可以检测到在简单重复序列重复单位数不同的DNA区域的多态性。钟鼎生物依托3730XL测序平台,提供SSR检测分析服务,帮您完成从实验设计到数据分析的全套服务。
一、SSR分子检测技术简介 SSR又叫微卫星DNA(MicrosatelliteDNA)，一般是指由1～6个核苷酸组成的基序(motif，或称基本重复单位)以串联排列的方式组成的DNA序列，它们的长度大都在100bp以内，其中以二核苷酸为基序的微卫星序列最为丰富。由于基本重复单元次数不同，从而形成SSR座位的多态性。每个SSR座位两侧一般是相对保守...
常见的SSR标记来自于公开数据库,也可以根据基因组序列自行开发新的SSR位点。 PCR扩增使用设计好的SSR引物,对目标DNA片段进行PCR扩增。扩增过程需要对实验条件进行优化,以确保结果的准确性和重复性。 电泳检测与结果分析对PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳或毛细管电泳,检测SSR位点的多态性。通过与标准分子量标记对比,分析不同...
SSR的检测SSR的检测 1.PCR反应后SSR的变性: 将PCR反应后的SSR材料每管加上8µl Loading Buffer(在PCR板上),置于PCR仪中变性10min,取出,放入冰水混合物中冷却。冷却后放入4℃冰箱里保存,待用。 2.制备聚丙烯酰胺变性凝胶电泳板: A.取大板,用水刷净(如果是用过的大板,表面有胶,则应用水浸泡,用小铲子铲...
SSR检测服务项目主要包含以下关键步骤和内容：SSR引物开发：通过富集微卫星序列，设计并验证2030条具有特定重复模式的微卫星序列。确保引物的多态性和特异性，为后续分析奠定基础。引物筛选：选取代表性样本，利用普通PCR引物进行扩增。通过高分辨率芯片电泳或PAGE验证引物的特异性、扩增效率及基因座多态性，确保...