种群遗传结构分析:SSR序列在种群中的分布和频率可以反映种群的遗传结构,有助于了解种群的分化、迁移和杂交等历史过程。 亲缘关系研究:SSR标记具有高度的多态性和共显性,因此可以用于亲缘关系的鉴定和物种进化关系的分析。 作物育种与分子标记辅助选择:在作物育种中,SSR标记可以作为分子标记,用于目标性状的跟踪、基因定位、遗传图谱
SSR分析简单序列重复SSR又称...主要梨品种细胞质遗传多态性分析 摘要 梨属于蔷薇科的梨亚科，品种很多，长期以来在分类上存在很多的问题。本论文的目的是研究主要梨品种细胞质遗传多态性。采用PCR-RFLP方法，对提取出的总DNA用10对叶绿体通用引物进行扩增，对PCR产物用限制性内切酶AluI，HaeIII，HinfI，Hin6I，RsaI，...
摘要:拟环纹豹蛛ParJosa是稻田害虫重要的自然天敌，在绿色防控中有重要作用。本研究基于拟环纹豹蛛转录组数据，使用微卫星鉴定工具软件(MISA)挖掘和分析其简单序列重复(SSR)位点。结果表明：拟环纹豹蛛转录组Unigene序列中共检测到6474个SSR位点，平均长度为12.36bp,分布于4411条Unigene上。单核昔酸重复类型为拟环...
SSR 标记是分析具有 1-6 个核苷酸重复序列的 DNA 区域的分子标记。因此,SSR标记是一种微卫星DNA,是VNTR的一种。SSR标记分析的主要重要性是遗传结构。SSR 标志物分析共显性特征。因此,SSR 标志物可以识别杂合位点。此外,这些标记允许鉴定多等位基因性质,同时鉴定多个等位基因,可重复性,高多态性和基因组的均匀分布。
第 31 卷第 9 期2010 年 9 月热 带作物学报Vol.31 No.9CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPSSep.2010甘蔗 EST 序列的 SSR 信息分析闫学兵1, 阙友雄1, 许莉萍1*, 郭晋隆1, 陈如凯1, 潘永保21 农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室, 中国福州2 美国农业部甘蔗研究所, 美国路州, 70360350002摘要从 NCBI 公共...
基于水稻基因组序列SSR的多态性分析 陈仲中 汪旭升 朱 军3 (浙江大学生物信息学研究所,浙江杭州310029;E2mail:zhongzhongchen@sohu.com;3通讯联系人,E2mail:jzhu@zju.edu.cn) Analysis of SSR Polymorp hism by Genome2Scale Comparing Between Varieties in Rice C H EN Zhong2zhong,W AN G Xu2sheng,Z...
家蚕微卫星序列也已经被广泛开发和应用,但是对于这些SSR序列在染色体上的分布和定位还有待进一步研究。 2.研究内容和方法 本研究将利用已有的家蚕微卫星序列设计引物,扩增不同长度的SSR片段,并将其经过PCR扩增后定位到家蚕的染色体上。本研究还将通过生物信息学方法对这些SSR序列进行研究,分析它们在基因组中的分布和...
微卫星DNA分子标记 | 一 微卫星序列简介 微卫星(microsatellite)又称简单序列重复(simple sequence repeats, SSR),是指以少数几个核苷酸(一般为1～6个)经多次重复单位组成的简单多次串联重复序列,如(CA)n、(TG)n等;又被称为短串联重复序列。简单序列重复其长度大多在100bp以内。根据微卫星的结构,Weber(1991)等...
2.【期刊论文】基于高通量测序的日本医蛭转录组及SSR序列分析 期刊:《云南农业大学学报:自然科学版》 | 2021 年第 002 期 摘要:【目的】分析日本医蛭在不同温度处理下,其转录组和简单重复序列标记(simple seauence repeats,SSR)信息。【方法】应用高通量测序技术,对不同温度下日本医蛭不同组织分别进行转录组测序...
摘要:目的分析茯苓转录组中简单重复序列(SSR)信息,以及含SSR的基因功能,为开发茯苓新型分子标记奠定基础。方法利用MISA软件搜索转录组Unigene及基因组scaffold中SSR,对含SSR的Unigene使用BlastX比对nr及KEGG数据库,注释其功能,并聚类分析。结果在转录组序列中发现4.57%的Unigene序列含有2 075个SSR,平均17 010条Unigene出现...