微卫星序列(microsatellite)或SSR(simple short repeat)是最具长度变异的基因组序列之一;SNP (single nucleotide polymorphism)是基因组序列中能在种系间稳定遗传的具有多态性的同一位点的单核苷酸.基于这两类序列开发的分子标记是目前最流行的进行生物基因组组装、基因发现、遗传图谱构建、基因功能研究、性状定位和分子育种...
(3)两种标记位点鉴定样品杂合率、亲子关系方面结果是一致的,样品杂合率均介于0.4～0.6之间,平均杂合率分别为0.525和0.514;SNP数据显示符合亲子关系位点百分比介于95.2%一99.9%之间,SSR数据显示符合亲子关系位点介于36～40个之间。综上所述,SSR和SNP两种标记在数据完整性、区分品种能力、位点稳定性等方面差别较小。关键...
SSR和SNP标记在玉米分子标记辅助 背景选择中的应用比较 宋伟,赵久然,王凤格,田红丽,葛建镕,王元东,赵衍鑫 (北京市农林科学院玉米研究中心/玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室,北京 100097) 摘要:利用SSR和SNP两种标记对H2321/J076/J076的BCF代群体进行分子标记辅助背景选择,比较两种 1 1 标记在分子标记辅助...
分类号密级UDC编号基于刺参转录组测序的SSR标记和防御机制相关SNP标记开发高琳琳(1011008)指导教师姓名**青教授专业名称海洋生物学论文答辩日期2013年6月8日学位授予日期2013年月日冬季养殖池塘环境因子变化及低温胁迫对刺参某些生理指标的影响MasteralDissertationDevelopmentofSSRmarkersandSNPsmarkersassociatedwithdefensemechanism...
本研究分别利用40对SSR荧光标记引物和1041个SNP位点,构建了72份国内常用玉米自交系的指纹数据库,并且进行遗传多样性和类群划分.结果如下: 1,40对SSR引物在72份玉米自交系上共有256个等位基因,平均值约为6.4个,变化范围是2-13个;共有339个基因型,平均值为8.5;多态性信息含量(PIC)的变化范围是0.099～0.850,平均...
微卫星序列(microsatellite)或SSR(simple shott repeat)是最具长度变异的基因组序列之一;SNP(single nucleotide polymorphism)是基因组序列中能在种系间稳定遗传的具有多态性的同一位点的单核苷酸。基于这两类序列开发的分子标记是目前最流行的进行生物基因组组装、基因发现、遗传图谱构建、基因功能研究、性状定位和分子育种...
基因组范围的特异SSR引物;然后利用21份辣椒材料对随机选择的160对SSR引物进行了可用性评价.同时,利用重测序数据,分析了辣椒全基因组范围的SNP位点.基于挑选的15,000个SNP位点,成功合成了一张高通量Infinium SNP分型芯片.利用这张芯片分别对辣椒一个种内F2群体(n=317株),一个种间F2群体(n=297株)和一个由399个...
SSR标记分别为54.11%和36.30%, SNP标记分别为72.55%和26.98%.依据高通量SNP标记结果, 从染色体水平看, 烟农15贡献率超过50%的染色体有2B,3B和6A; 而鲁麦14在除此之外的18条染色体的遗传贡献率大于50%.青农2号遗传组成图谱揭示了遗传物质多以较大染色体片段形式从亲本传递至子代.对亲本和子代进行多年多点的农艺性...
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