FAP +成纤维细胞和SPP1 +巨噬细胞主要富集在肿瘤组织中,之前又发现 MSCs 和骨髓细胞浸润之间存在高度的相关性。为了研究所有细胞类型的浸润状态,作者使用 CIBERSORTx 评估了14 个独立的 CRC 队列中识别的 58 个细胞类型的浸润情况,发现FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞是所有队列中相关性最高的群体。 为了进一步揭...
今天分享的这篇文献上个月刚发表在Nature Communications,主要内容是结合单细胞转录组和空间转录组技术,揭示了FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞的互作,及其对于结直肠癌进展、免疫治疗等方面的影响。 1. 背景介绍 结直肠癌 (CRC) 是第三大最常见的恶性肿瘤(仅次于肺癌和乳腺癌),每年在全世界造成约 800,000 人死亡...
确定了结直肠癌中存在多样化的肿瘤微环境景观,其中「FAP+成纤维细胞」和「SPP1+巨噬细胞」在肿瘤组织中富集。这项工作进一步强调了FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞浸润高度相关,它们的存在与「淋巴细胞浸润」呈负相关,并预示患者存活率低。它们的共存与丰富的「细胞外基质」表达有关,从而促进肿瘤「促纤维增生结构」...
随后,作者利用scRNA-seq数据预测FAP+成纤维细胞的分化轨迹,该分析预测肿瘤特异性FAP+成纤维细胞可能来源于FGFR2+成纤维细胞或ICAM1+特络细胞(图3h)。FAP+成纤维细胞的分化是通过复杂的转录因子(transcription factors, TF)网络调控的,作者分别评估了这10种MSC亚型top 5表达的TF以及TF调控网络中top 5活性的调节子(...
g: 用流式分选FAP+ fibroblasts,验证在tumor中显著高; h: RNA velocity分析表明,FAP+ fibroblasts有可能起源于FGFR2+ fibroblasts 或 ICAM1+ telocytes; i/j/k/l: 用pySCENIC分析,10个细胞亚型的top 转录因子和调节子,发现TWIST1 是FAP+ fibroblasts特异性表达; ...
7、FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞的相互作用可能对促结缔组织增生肿瘤微环境的形成有促进作用 使用R包 “NicheNet” 对FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞的细胞-细胞间通讯机制进行研究,作者发现FAP+成纤维细胞通过粘附配体受体对 COL1A1/LAMA1-ITGB1与SPP1+巨噬细胞直接联系(图7a)。此外,FAP+成纤维细胞通过表达...
7.FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞的相互作用可能有助于促结缔组织增生肿瘤微环境的形成 使用R包“NicheNet”对FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞的细胞-细胞间通讯机制进行研究,作者发现FAP+成纤维细胞通过粘附配体受体对COL1A1/LAMA1-ITGB1与SPP1+巨噬细胞直接联系(图7a)。此外,FAP+成纤维细胞通过表达TGF-β超...
此外,文章通过流式细胞术验证了肿瘤特异性成纤维细胞的浸润(图3f、g),结果表明CRC肿瘤组织中FAP+成纤维细胞浸润显著增加,NT5E+和FGFR2+的浸润显著减少。 随后,作者利用scRNA-seq数据预测FAP+成纤维细胞的分化轨迹,该分析预测肿瘤特异...
The cell proportion diagram indicates that the dMMR group has a higher proportion of ACTA2 + fibroblasts than other groups, while the pMMR group has a significantly increased proportion of FAP + fibroblasts than other groups (Fig. 5A). The results of immunofluorescence in GC patient ...
5.FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞的高浸润与较差的患者生存率相关。 作者使用CIBERSORTx评估了由scRNA-seq鉴定的50个细胞亚群在14个独立的CRC队列中的浸润状况(图5a),发现FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞的相关性最高。为了进一步揭示这两种细胞类型之间密切相关的临床意义,作者比较了不同水平FAP+成纤维细胞和SPP...