在这篇文章中,研究者们发现了: 一群以表达Spp1、Fn1和Arg1为标志的促纤维化巨噬细胞(称为Spp1巨噬细胞),在器官损伤后表达增加;血小板来源的趋化因子CXCL4可以促纤维化Spp1巨噬细胞分化过程;Cxcl4的缺失可抑制促纤维化Spp1巨噬细胞的分化,并减轻心脏和肾脏损伤后的纤维化。 研究结果一:ECM调节因子评分识别促纤...
研究人员发现在6月龄AD模型小鼠海马CA1区小胶质细胞吞噬突触数量明显增多,并且补体蛋白c1q和SPP1表达明显增加。进一步荧光原位杂交实验发现c1q主要来源于小胶质细胞上,并发现在AD患者中海马组织中SPP1表达在血管周围。 随后通过流式细胞技术发...
RNA速率分析显示肿瘤特异性FAP +成纤维细胞可能起源于FGFR2 +成纤维细胞或ICAM1 + telocytes。FAP +成纤维细胞的分化由复杂的转录因子网络协调,因此使用pySCENIC进行分析,发现TWIST1在FAP +成纤维细胞的调节网络中具有最高的表达水平和活性,可能是驱动该分化途径的主要转录因子。 另外,缺氧是肿瘤微环境最重要的特征之...
30,31在 ALS 的发病过程中,星形胶质细胞和小胶质细胞被激活,32促进疾病的进展。30 虽然Spp1 在 ALS 中的作用在很大程度上是未知的,但这种蛋白质的 CSF 水平已被提议作为 ALS 的潜在生物标志物。33,34最近的一项研究表明,Spp...
作者进一步分析了结直肠癌肝转移的肿瘤微环境中的基质细胞成分(图3A–3C), UMAP表示对所有基质细胞的聚类结果,图3B对应细胞类型注释,图3C对应簇数注释。在不同的簇中,存在三种主要细胞类型,包括成纤维细胞、内皮细胞和肝星状细胞。与mCRC相关的成纤维细胞存在于簇 1 和 4 中。热图描绘了每个基质细胞簇中五个最...
作者进一步分析了结直肠癌肝转移的肿瘤微环境中的基质细胞成分(图3A–3C), UMAP表示对所有基质细胞的聚类结果,图3B对应细胞类型注释,图3C对应簇数注释。在不同的簇中,存在三种主要细胞类型,包括成纤维细胞、内皮细胞和肝星状细胞。与mCRC相关的成纤维细胞存在于簇 1 和 4 中。热图描绘了每个基质细胞簇中五个最...
随后,作者利用scRNA-seq数据预测FAP+成纤维细胞的分化轨迹,该分析预测肿瘤特异性FAP+成纤维细胞可能来源于FGFR2+成纤维细胞或ICAM1+特络细胞(图3h)。FAP+成纤维细胞的分化是通过复杂的转录因子(transcription factors, TF)网络调控的,作者分别评估了这10种MSC亚型top 5表达的TF以及TF调控网络中top 5活性的调节子(...
间充质干细胞(mesenchymal stem cells)是一种具有多能性和自我更新能力的细胞类型,可以分化为多种细胞类型。在该文件中,研究人员将间充质干细胞的一个亚群体标记为FAP+成纤维细胞。 肿瘤免疫微环境通常可以根据免疫细胞和CD8 +T细胞的浸润被归类为免疫排除型immune-excluded、发炎型inflamed (hot)和免疫荒漠型immune...
为了进一步确定SPP1+巨噬细胞的主要调控因子,作者进行pySCENIC分析,结果表明编码使小鼠巨噬细胞向M1表型极化的主转录因子STAT1在SPP1+巨噬细胞中高度活跃(图4i-l)。由于FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞密切参与缺氧诱导途径,作者推测在肿瘤的缺氧区域存在基质细胞介导的网络,该网络连接巨噬细胞和MSC,共同促进CRC微环境...
这种表达模式与肿瘤细胞、成纤维细胞等其他细胞类型的表达方式相呼应。通过分析不同细胞类型间的关系,发现CS TAM极性与肿瘤控制细胞(如T细胞、B细胞和DC)的丰度以及TME中免疫和非免疫细胞的关键基因表达谱密切相关。最后,该研究强调了CS TAM极性本身在多种癌症适应症中所提供的临床信息的重要性,并证实CXCL9+和SPP1+...