若您可以提供downloader的gene id所对应的这些信息,那么有以下几种主要方法可以实现symbol转换:1. 使用生物信息学数据库的ID转换工具,如Ensemble、Entrez、Uniprot等,上传gene id信息并选择相应的基因组版本,可以批量将gene id转换为symbol。2. 从对应的基因组资源数据库下载注释文件,该文件中包含gene id和...
另一种是Profile子数据库,以基因为单位,检索其相应癌种的基因表达谱,用得较少。带教老师会以实操的...
等跳出top250之后,页面会有一个选项是select columns,然后打开这个选项,里面勾选gene symbol等你要的...
我先确定了自己需要的gene symbol:LINC00460 AC079466.1 AL031123.1 AP000757.1 AL035661.1 LINC01558 AC103563.7 MCF2L-AS1 AC005082.1 AC148477.4 AL031710.1 ZNF350-AS1。但是在使用GSE3的时候,发现它的平台文件GPL9和GPL10没有常规的id比如gene symbol。因为我已经手握gene symbol了,所以逆向思维想问问大神们,是否有...
在GEO分析的时候先选top250,等跳出top250之后,页面会有一个选项是select columns,然后打开这个选项,里面勾选gene symbol等你要的信息,然后点set,之后的页面就是有你勾选的信息的了,如果要看全部,就再点save all results,新页面就是有全部测序结果的还有你选的信息的内容啦 作为...
func_anno__gene__col: gene_symbol ;func_exp__id__col: V1 ;nested_function: TRUE ;run_file...
请问问题解决了吗?最近也遇到类似问题