命令行窗口输入spm启动,然后依照图片指引操作。 reslice通常用于ALL模板重新分割,使得模板匹配SPM12预处理好的NII文件,最后使得dpabi能用reslice后的ALL模板去提取ROI文件。 Image Defining Space 是RELICE 的模板,Images to Reslice 是要把模板Slice复刻到的文件。
realign:estimate+reslice Data:New:Session,然后选中data下出现的“Session”选项。点击“SpecifyFiles”,用spm文件选择器选择刚做完时间校准的全部图像(a*.img)。 Filename Prefix:默认为r 其余选项采用默认设置,点击上方绿色的三角开始运行。 做完这一步,能给出该序列中被试的头动情况,以作为是否放弃该数据的依据...
应用变换:选择Realign 模块的 Reslice 模块,选择 fMRI 图像,其他参数不变。运行结束后会生成 r*.nii和mean*.nii文件,分别表示头动校正后的文件以及平均 fMRI 图像。 2. 将 T1 和fMRI 图像对齐: 虽然是为了将 fMRI 配准到 MNI 模板, 但是由于 fMRI 图像本身分辨率太低, 直接使用非线性的方式将 fMRI 配准到...
第一、启动:Slice timing 用鼠标单击【Slice timing】,弹出Batch Editor【右侧方框,这里是我们进行后续所有操作的地方】。 我们来介绍一下,右侧设置相应的参数 Help on:Slice timing——介绍了什么是时间层校正,以及应该设置哪些参数,生成的结果文件什么样。 Data——用于选择对应的数据文件 Number of Slices——全脑...
% 1 - don't reslice the first image. % The first image is not actually moved, so it may % not be necessary to resample it. % 2 - reslice all the images. % If which is a 2-element vector, flags.mean will be set % to flags.which(2). ...
目的:改变图像大小(图像重采样) 打开spm–fMRI–coregister 出现下拉框 如果只是对图像做重采样的话,选择reslice即可 出现coregister界面: Image Defining Space 选择目标大小的图像(相当于一个模板) Images to Reslice 选择需要改变大小的图像 选择完成后点击绿色箭头运行即可 运行完毕后会在原图像的基础上生... ...
% 0 - don't create any resliced images. % Useful if you only want a mean resliced image. % 1 - don't reslice the first image. % The first image is not actually moved, so it may not be % necessary to resample it. % 2 - reslice all the images. % % fudge - adjust the da...
重采样具体步骤: p1:打开 matlab,命令行输入spm fmri p2:点击Coregister(Reslice) p3:点击Image Defining Space——输入任意一个被试在一阶分析时生成的mask.nii文件 p4:将我们想要的ROI模板输入,这里我们选取上一节制作的Precuness_ALL.nii ROI mask
SPM操作步骤 第一步Realign，选estimate&reslice，结果生成mean文件。第二步Coregister，先选择Coregisterestimate，reference选择mean文件，sourceimage选择解剖像文件，然后选Coregreslice，ImageDefiningSpace和Imagetoreslice都选解剖像文件，run第三步是Normalise，A:选estimate&Write，source文件选择解剖像文件，imagetowrite...
SPM12 Realign (Estimate and Reslice)filename