SPM操作步骤 第一步Realign，选estimate&reslice，结果生成mean文件。第二步Coregister，先选择Coregister estimate ，reference选择mean文件，source image选择解剖像文件，然后选Coreg reslice，Image Defining Space和Image to reslice都选解剖像文件，run
SPM操作步骤 第一步Realign，选estimate&reslice，结果生成mean文件。第二步Coregister，先选择Coregisterestimate，reference选择mean文件，sourceimage选择解剖像文件，然后选Coregreslice，ImageDefiningSpace和Imagetoreslice都选解剖像文件，run第三步是Normalise，A:选estimate&Write，source文件选择解剖像文件，imagetowrite...
第二步Coregister,先选择Coregister estimate ,reference选择mean文件,source image选择解剖像文件,然后第一步Realign,选estimate&reslice,结果生成mean文件。 第二步Coregister,先选择Coregister estimate ,reference选择mean文件,source image选择解剖像文件,然后选Coreg reslice,Image Defining Space和Image to reslice都选解...
spm_coreg.m spm_cov2corr.m spm_create_vol.m spm_cross.m spm_csd_fmri_gu.m spm_csd_fmri_mar.m spm_csd_fmri_mtf.m spm_cva.m spm_cva_ui.m spm_dartel_integrate.m spm_data_hdr_read.m spm_data_hdr_write.m spm_data_id.m spm_data_read.m spm_data_write....
你只需要在script的开头写上spm_jobman('initcfg'),在正文中用类似于jobs{1}.spatial{1}.coreg{1}.estimate.source = cellstr(s)等设置具体的参数,在最后用spm_jobman('run',jobs)让上述设置好的参数以及流程跑起来就可以了。有时需要最后把跑过的job从工作空间中删除,需要使用clear jobs。我在下面提供的...
spm_coreg.py spm_cov2corr.py spm_create_vol.py spm_cross.py spm_csd_fmri_gu.py spm_csd_fmri_mar.py spm_csd_fmri_mtf.py spm_cva.py spm_cva_ui.py spm_dartel_integrate.py spm_data_hdr_read.py spm_data_hdr_write.py spm_data_id.py spm_data_read.py spm_data_write.py spm_dcm...
matlabbatch{3}.spm.spatial.coreg.estimate.source = {anatfile};%ananfile 字符串末尾得加一个1,细看对比stupid_batch_nii_third_formal_compilable matlabbatch{3}.spm.spatial.coreg.estimate.other = {''}; matlabbatch{3}.spm.spatial.coreg.estimate.eoptions.cost_fun ='nmi'; ...
数据的预处理一、概述:数据的预处理(preprocess):(1)Convert dicom files to hdr files and img images;(2)Slice Timing;(3)Realign: Estimate & Reslice;(4)Coreg: Estimate;(5)Segment;(6)两次Normalise: Write;(7)Smooth;(8)Fmri model specification;(8)Model Estimation。二、DICOM Import:说明:转换完...
Coreg Estimate:---[只需要将旋转的矩阵写入到hdr文件中,不需要生成新的文件,也就是对3D文件做一个刚体的变换,变换到功能像空间里] Reference Image---[选择头动校正生成的mean*文件] Source Image---[选择3D文件] 其余项目默认即可。 3、说明:Source image与Reference image的关系,可以认为是将结构像向以mean...
主要内容 •脑成像数据分析软件介绍•Matlab基本知识•SPM基本知识•利用SPM处理任务fMRI数据（原理和操作）•任务态fMRI数据处理技巧 脑成像数据分析软件 •SPM(statisticalparametricmapping)–Matlab-based–TaskfMRI,MRI(VBM),PET/SPECT,EEG/MEG–Course,manual,Wiki,Email-list •AFNI(AnalysisofFunctional...