使用拆分读取(split read) 可实际地改善只读数据的性能。对于拆分读取,数据库服务器要么从主要块区读取数据,要么从镜像 … www.ibm.com|基于2个网页 2. 分离读取 ...问,取数推测(load speculation),分离读取(split read)等先进体系 www.doc88.com|基于2个网页...
基于split-read方法的基因组结构变异识别算法潘俊
split read mapping split reads:如果一个测序read比对到基因组上的两个不同位置,此时就发生了split read; 举例来说,如果从RNA测序得到的150bp长的read,其中1-75碱基比对到了外显子2的3’端,76-150碱基比对到了外显子3的5’端,此时认为发生了split read。 chimeric read:split reads的一类;chimeric read常被...
高通量测序数据中Split read映射方法的研究
README GPL-3.0 license SPLITREADER SPLITREADER is a bioinformatic pipeline dedicated to the discovery of non-reference TE insertions with Target Site Duplications (TSDs) through the use of Illumina short genome sequence reads and a reference genome. ...
本文主要研究split-read方法来识别变异,首先分析了高通量测序技术平台与其产生的数据,以及相关的概念,如read,pair-end read,split-read以及全基因组重测序等概念。然后总结各种基因变异事件,基因变异事件不仅仅由类型所决定,其发生的尺寸和位置都决定着应该使用不同的策略进行识别。为此,针对indel的识别提出了基于split-...
# 按文件名排序 ls |sort -n # 递归显示子目录 ls -R # 按文件大小排序 ls -lS # 查看文件大小和时间 ls -lh # 按时间逆序排序 ls -ltr # 只显示目录,不会显示子目录文件 ls -d *htmls # 列出文件或目录的节点号 ls -i split # 把文件切割每个10行的小文件 split -l 10 file.txt # 把...
Comments - Readwritesplit 7 years, 6 months agoMohammad Lahlouh Re: My setup can't detect Master and Slave server Hello, Eureka GRANT REPLICATION CLIENT ON *.* TO 'myuser'@'%'; give maxscale user access to replica, and I had issue in maxscale logging so i didn't see the error ...
== SCISSORS == Overview: SCISSORS is a split-read aligner that maps orphaned read mates (i.e. where one end-mate is aligned with high mapping quality, but the other mate is unmapped), as well as re-maps severely clipped reads (reads mapped with many unaligned or “clipped-off” bases...
Java中的我们可以利用 split 方法(Java.lang.string.split)把字符串按照指定的分割符进行分割,然后返回字符串数组,下面是string.split的用法实例及注意事项。 split 方法 将一个字符串分割为子字符串,然后将结果作为字符串数组返回。 stringObj.split([separator,[limit]]) ...