DlSPL共含有10个motif,14个龙眼DlSPL蛋白均有Motif1、Motif2和Motif3(图3)。Motif5、Motif6、Motif8、Motif9只存在于DlSPL6和DlSPL10;Motif7和Motif10只存在于DlSPL1、DlSPL12和DlSPL14。另外,在进化树聚集的成员Motif大多相同,例如DlSPL2、DlSPL9、DlSPL15的Motif完全相同;DlSPL3、DlSPL4、DlSPL5的Motif完全...
(b)从SPL基因编码的氨基酸序列中重新预测的基序是彩色编码的。Motif 1 是 SBP 结构域,存在于所有 SPL 中。基序 8 由 MRE 编码,它存在于某些SPL基因的最后一个外显子中。 (c) 热图表明小麦TaSPL基因在 Log 2上九种不同组织中的表达模式TPM(每百万转录本)规模。蓝色表示较高的表达,白色表示较低的表达。九...
A novel Zinc-binding motif revealed by solution structures of DNA-binding domains of Arabidopsis SBP-family trans- cription factors. J Mol Biol 337, 49–63. Yang L, Conway SR, Poethig RS (2011). Vegetative phase change is mediated by a leaf-derived signal that re- presses the ...
Gandikota 等 (2007) 对拟南芥 AtSPL3 基因的 microRNA156识别位点进行突变, 发现突变植株中 AtSPL3的转录水平显著提高, 而microRNA156的含量 与植物的生理年龄呈负相关, 降低microRNA156活性 会导致植物出现早熟表型(Cheng et al., 2021).AHL 蛋白(AT-hook motif nuclear localized)可以通过提高 microRNA156/...
(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/) 用途 Usage 蛋白理化性质预测 Prediction of protein physicochemical properties 亚细胞定位预测 Prediction of subcellular localization 保守基序分析 Conservative motif analysis 多重序列比对 Multiple sequence alignment 启动子顺式作用元件预测 Prediction ...
SPL(SQUAMOSA promoter binding protein(SBP)-like)是植物特有的转录因子,在植物生长发育和代谢中具有重要作用.本研究基于课题组前期获得的马尾松(Pinus massoniana)转录组数据筛选SPL家族成员,通过生物信息学方法,对马尾松SPL基因家族成员进行蛋白理化性质分析,亚细胞定位预测,保守蛋白基序(motif)分析和系统进化树分析.结果...
展开更多 SPL(Squamosa Promoter-binding protein-like)family proteins are plant specific multifunctional transcription factors.There are 19 OsSPL genes in rice,all of which contain a highly conserved SBP domain,which is responsible for binding to the core motif GTAC of the downstr...MORE 作者 胡...
通过对番茄中的ＳＰＬ基因Ｓｏｌｙｃ０５ｇ０１５５１０．２、Ｓｏｌｙｃ１０ｇ０７８７００．１进行表达量分析，发现这２个基因可能参与调控果实成熟衰老进程。另外，通过对非生物胁迫下的转录水平进行分析得知，拟南芥中的ＡＴ５Ｇ４３２７０可能参与对盐胁迫、热胁迫条件下的响应，ＡＴ１Ｇ２７３６０、ＡＴ１Ｇ２７３７...
Furin cleaves only HA with the [R.bar]-X-K/R-R motif in the presence of calcium but not the other motif, whereas type II membrane proteases, mosaic serine protease large form (MSPL) and its splice variant transmembrane protease serine 13 (TMPRSS13) recently found by us, with unique su...
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