总之,这些结果表明,在 V1 的谷氨酸能神经元中,上层亚类(L2/3 和 L4)类型的转录组规范化晚于低层亚类(L5 和 L6)类型。L2/3 神经元类型在空间上是分离的研究者从 P17 开始将 L2/3 谷氨酸能神经元分为三种类型(A、B 和 C),这是在 P14 视觉开始后评估的第一个时间点(图 3A)。这些可在组织中通过分别...
来自美国西达赛奈医学中心的研究人员将单细胞核测序(snRNA-seq)与空间转录(10x Visium)和单细胞空间原位超多色荧光检测(CODEX)分析相结合分析人类膀胱癌,发现根据肿瘤CDH12的丰富程度对患者进行分层可以比目前确定的膀胱癌亚型提供更好的预后预测,为设计生物标志物指导的临床试验提供了新思路。研究成果“An N-Cadherin 2...
来自美国西达赛奈医学中心的研究人员将单细胞核测序(snRNA-seq)与空间转录(10x Visium)和单细胞空间原位超多色荧光检测(CODEX)分析相结合分析人类膀胱癌,发现根据肿瘤CDH12的丰富程度对患者进行分层可以比目前确定的膀胱癌亚型提供更好的预后预测,为设计生物标志物指导的临床试验提供了新思路。研究成果“An N-Cadherin 2...
公司拥有Nanopore、PacBio、Illumina、Waters、10XGenomics等主流服务平台,以及基于云架构的生物云计算平台—百迈客云,提供涵盖人重外显子、三维基因组、单细胞与空间转录组、基因组组装、转录调控、微生物、群体遗传、质谱及表观遗传等研究方向的技术服务...
作者使用单分子FISH(smRNA-FISH)验证了胫骨前肌MTJ处Col22a1和Adamts20的表达,从而证实了该肌核种群的定位(图1d)。这些数据表明NMJ和MTJ肌核的强烈的空间转录异质性,表明合胞体内的位置和相关的近端信号传导是转录谱的主要决定因素。 图1d :Col22a1和Adamts20的smRNA-FISH在5个月的胫骨前纵切面上的代表性图像...
通过CosMx单细胞水平的空间转录组数据,研究人员识别了表达特定标记基因如HAVCR1和VCAM1的iPT细胞亚群,并发现这些细胞在健康和疾病肾脏样本中的分布差异。此外,利用Monocle软件进行的伪时间分析揭示了从正常近曲小管细胞(PT)到两种iPT亚型(iPT_VCAM1+和iPT_HAVCR1+)的连续分化路径。这项分析不仅增进了我们对肾脏疾病中...
利用空间转录组学,作者可视化了动脉塞中细胞外基质成分和Notch相互作用的表达。这些发生在母体和胎儿细胞之间的配体-受体相互作用可能是介导母体动脉转化的关键,而母体动脉转化对于成功妊娠来说至关重要。 图5 子宫动脉转化中配体-受体相互作用 讨论 这项研究讨论了滋养层细胞侵入子宫在妊娠中的关键作用,以及异常的滋养...
烈冰生物已正式上线单细胞核转录组测序、AbSeq、单细胞TCR-Seq、单细胞ATAC-Seq、空间转录组测序产品。结合优质的scRNA-Seq服务,多组学联合助力科研人员探索时空等多维度、全方位的动态变化的生物学信息。烈冰生物为您提供优质的单细胞研究完整解决方案!欢迎垂询!
百迈客是国内首批引进10xGenomics单细胞测序平台,使用Chromium系统采用先进的微流控、油滴包裹和barcode标记等技术实现一次性分离、高效标记捕获;同时具有10x 单细胞转录组、单细胞核转录组、空间转录组、单细胞免疫组库、全长转录组测序,实现10x平台全面优质服务;已经具有大量单细胞分离捕获,极低量RNA反转录扩增建库成功...
图3 marker 基因的表达模式和细胞空间分布 图4 细胞类型特异性基因的富集分析 3.番茄茎尖细胞轨迹分析 单细胞转录组学可以捕获具有过渡状态的细胞,从而使本文能够追踪特定细胞类型的发育轨迹。为了获得茎尖细胞发育轨迹图,本文用uMAP算法分析clusters聚类和等级结构(图3c),鉴定出相似的clusters,对应分生组织细胞的clusters...