每个基因都是一个乐器，而RNA-seq数据就是记录了演奏过程中每个乐器的声音大小。通过分析RNA-seq数据，...
图. 人内嗅皮层snRNA-seq揭示阿尔茨海默病中细胞类型特异性标记基因和细胞类型特异性改变 同样是阿尔兹海默症疾病,Mathys等人通过对冷冻的去世后病人脑组织进行snRNA-seq,共鉴定到了人类大脑的主要细胞类型:兴奋性神经元(NRGN标记),抑制性神经元(GAD1),星形胶质细胞(AQP4),少突胶质细胞(MBP),小胶质细胞(CSF1R和CD7...
图. 人内嗅皮层snRNA-seq揭示阿尔茨海默病中细胞类型特异性标记基因和细胞类型特异性改变 同样是阿尔兹海默症疾病,Mathys等人通过对冷冻的去世后病人脑组织进行snRNA-seq,共鉴定到了人类大脑的主要细胞类型:兴奋性神经元(NRGN标记),抑制性神经元(GAD1),星形胶质细胞(AQP4),少突胶质细胞(MBP),小胶质细胞(CSF1R和CD7...
与酶解法制备原生质体相比,直接对植物组织抽核进行snRNA-seq测序的优势在于: (1)适用样本类型丰富,应用范围广,操作步骤相对简单; (2)因为核膜稳定性比细胞膜高,所以组织冻存后细胞核膜不会被破坏,冻存组织可以通过制备细胞核悬液进行单细胞测序; (3)样本保存及运输简单,避免活体植物在运输过程中形成二次伤害,影响...
脑组织样本的snRNA-seq 对于脑组织来说, scRNA-seq并不能全面地分析神经细胞的类型。一些细胞类型更容易受到组织解离过程的影响,比如在成人的新大脑皮层中,非神经元细胞在解离中比神经元耐受性更好,在单细胞悬浮液中大量存在;在小鼠新皮层中,第...
对于脑组织来说, scRNA-seq并不能全面地分析神经细胞的类型。一些细胞类型更容易受到组织解离过程的影响,比如在成人的新大脑皮层中,非神经元细胞在解离中比神经元耐受性更好,在单细胞悬浮液中大量存在;在小鼠新皮层中,第5层parvalbuin阳性的间神经元和皮质下突起的谷氨酸能神经元的比例低于预期。相反,细胞核对机械...
脑组织样本的snRNA-seq 对于脑组织来说，scRNA-seq并不能全面分析神经细胞的类型。一些细胞类型更容易受到组织解离过程的影响，如成人的新大脑皮层中，非神经元细胞在解离中比神经元耐受性更好，在单细胞悬浮液中大量存在；在小鼠新皮层中，第5层parvalbuin阳性的间神经元和皮质下突起的谷氨酸能神经元的...
snRNA-seq是一种在单个细胞核级别上研究细胞表型的单细胞核酸测序方法。相比于传统的单细胞RNA测序，该技术能更好地保留细胞的原始特性，避免受到细胞溶解等因素的影响。在snRNA-seq中，单个核被包裹在胶体颗粒中，其中包含了反转录和扩增RNA的反应混合物。该技术难度较高，需要特别注意核提取和反转录过程...
这一发现从侧面反映出人脑和鼠脑在进化过程中的差异性。利用NanoString基因表达分析,检测到小胶质细中IRF8基因和少突胶质细胞中的CA2基因在AD样本中均上调表达,与snRNA-Seq结果相吻合。同时对代谢通路的分析也反映出AD病程会导致神经细胞衰退,认知能力下降的AD病理特征。
scRNA-seq和snRNA-seq都是单细胞级别的RNA测序方法,它们主要的区别在于样本处理过程中所使用的细胞类型。scRNA-seq用于研究单个完整的细胞,包括细胞核和细胞质中的RNA;而snRNA-seq用于研究单个细胞核中的RNA。因此,相比于scRNA-seq,snRNA-seq可以更好地保留细胞的原始特性,并且不会受到细胞溶解等因素的影响。