其中,SnRK2家族被认为是马铃薯逆境抗性的关键基因家族之一。 SnRK2家族是植物中一类重要的蛋白激酶,在植物生长发育和逆境应答中发挥着重要的调控作用。为了进一步研究SnRK2家族在马铃薯中的功能以及其在逆境应答中的调控机制,科研人员进行了马铃薯SnRK2基因的克隆及功能分析。 首先,研究人员通过生物信息学方法,在马铃薯基因...
和hmmer两种方法在普通小麦中共鉴定到30个SnRK2基因家族成员。系统发育分析表明,SnRK2基因在 普通小麦及其祖先物种的进化过程中高度保守。利用RNA seq数据分析小麦S nRK2基因在不同组织以及不同胁迫条件下的表达模式,结果表明,小麦SnRK2基因家族成员在不同组织以及不同胁迫条件下...
序列分析发现,该家族基因蛋白结构在 N 端相对保守,而在 C 端极其特异;聚类结 果表明葡萄 SnRK2 基因家族可以分为 3 个亚家族;对这 8 个基因所编码的蛋白质进行分析发现,其富含 酸性氨基酸,且均为亲水蛋白;基因组结构分析发现 VvSnRK2.2 和 VvSnRK2.8 含有 10 个外显子,其他 6 个均含 9 个外显子;对...
SnRK2是植物特有的一类Ser/Thr类蛋白激酶,在植物逆境生理过程中扮演了重要的角色。利用隐马可夫模型搜索和系统建树的方法,在苹果基因组中鉴定出了16个SnRK2基因家族成... 陈娜娜,刘金义,蔡斌,... - 《中国农学通报》 被引量: 11发表: 2013年 葡萄SnRK2家族基因的鉴定与表达分析 SnRK2家族基因克隆荧光定量基因表...
SnRK2是植物特有的一种丝氨酸/苏氨酸类蛋白激酶,在脱落酸信号转导,植物生长发育以及抵御逆境胁迫过程中起着重要作用.为探究马铃薯SnRK2基因家族的功能,本研究以'青薯9号'为试验材料,通过RT-qPCR技术分析其在不同非生物胁迫下的表达模式,筛选出对非生物胁迫相对敏感的基因进行克隆,并利用Plant CARE,ExPASy,Cell-PLoc...
已在多种植物中得到了鉴定,其在植物生长发育,胁迫响应和信号转导中发挥了重要作用.为探究三浅裂野牵牛中SnRK2基因家族的成员并推测其功能,利用拟南芥SnRK2蛋白序列,通过生物信息学方法筛选并鉴定ItfSnRK2基因家族成员,对各成员的特征进行分析,采用转录组数据分析ItfSnRK2各成员在不同组织和非生物胁迫下的表达谱.结果...