将每个SNP作为固定因子进行回归分析。MLM模型中，将每个SNP作为固定因子进行回归分析，将亲缘关系矩阵（kinship或者A矩阵）作为随机因子，进行SNP的显著性检验，P值就是GWAS分析的p-value，effect就是SNP的effect值。如果有其它因素需要考虑，就放到协变量里面，比如性别，PCA，Q矩阵等。MLM和GLM不同的就是...
根据GWAS结果画多基因评分 | p值阈值的设定决定了计算出的PGS分布。左边设定的很严格,只纳入18个SNP,所以画出来比较丑#ggplot2#UK Biobank 发布于 2023-05-24 08:56・IP 属地北京 写下你的评论... 6 条评论 默认 最新 Neil Hubert 朱教授,请问如果是研究不同人群间差异,p阈值设为多少合适呢?我最近做的...