1.Wheat-SnpHub-Portal网站主页 首先打开门户网站（http://wheat.cau.edu.cn/Wheat_SnpHub_Portal/）【该网址目前还可以在“小麦族多组学数据网站”（http://202.194.139.32）中的"Other links"页面找到】。找到对应数据集，并点击“Access the dataset”，进入该数据集的SnpHub实例。每次加载新“实例”时，会有...
该研究提出了一种可在任意Linux服务器上通过简易配置并快速部署的大规模基因组变异数据库模型——SnpHub（主页：http://guoweilong.github.io/SnpHub）。该数据库模型适用于对大规模样本的VCF文件实现在线的快速检索和轻量级的分析和可视化功能。该工作目前同时提供了7套小麦及祖先种变异数据集的查询数据库：Wheat-SnpHub...
对于Pont等的数据,采用whealbi.unimputed_filtered.vcf.tar.gz文件解压缩后的whealbi.unimputed_filtered.vcf进行下一步。同时,进入下一步的还有包含样本信息的Whealbi_Wheat_final_garden_141013.xlsx文件。 对于IWGSC RefSeq v1.0,采用161010_Chinese_Spring_v1.0_pseudomolecules.fasta文件进行下一步 对于IWGSC RefS...
对于Pont等的数据,采用whealbi.unimputed_filtered.vcf.tar.gz文件解压缩后的whealbi.unimputed_filtered.vcf进行下一步。同时,进入下一步的还有包含样本信息的Whealbi_Wheat_final_garden_141013.xlsx文件。 对于IWGSC RefSeq v1.0,采用161010_Chinese_Spring_v1.0_pseudomolecules.fasta文件进行下一步 对于IWGSC RefS...
对于Pont等的数据,采用whealbi.unimputed_filtered.vcf.tar.gz文件解压缩后的whealbi.unimputed_filtered.vcf进行下一步。同时,进入下一步的还有包含样本信息的Whealbi_Wheat_final_garden_141013.xlsx文件。 对于IWGSC RefSeq v1.0,采用161010_Chinese_Spring_v1.0_pseudomolecules.fasta文件进行下一步 ...
一千零一技|Wheat-SnpHub-Portal数据库介绍及使用示例 理清SNP、SNV、CNV等一些概念 论SNP的“二态性”「博客翻译」SNP过滤教程 利用snpEff对SNP进行注释 小麦多组学网站上线小麦重测序数据了 【总结】小麦多组学网站介绍 山农35个野生二粒小麦的重测序数据|小麦多组学网站 【一作解读】基因组重测序揭示六倍体普通...