在将样本的reads比对到参考基因组上后,比对到某个SNP的reads数量越多,则该SNP的Q值越大即越可信。 连锁不平衡(LD) 进行群体遗传结构分析时,如果位点之间有强连锁的关系则会影响分析的结果,因此需要过滤掉互相之间连锁不平衡的SNP。
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example2.png 质量(Quality) 在将样本的reads比对到参考基因组上后,比对到某个SNP的reads数量越多,则该SNP的Q值越大即越可信。 连锁不平衡(LD) 进行群体遗传结构分析时,如果位点之间有强连锁的关系则会影响分析的结果,因此需要过滤掉互相之间连锁不平衡的SNP。