##建树分析 /gluster/home/yangtao/miniconda3/envs/gubbins/binFastTree-gtr -nt clean.core.aln > clean.core.tree
为了基于SNP数据构建系统发育树,你可以按照以下步骤进行: 准备SNP数据: 确保你拥有包含SNP变异的VCF(Variant Call Format)文件。这是进行SNP建树的基础数据。 选择适合的建树软件或库: 有多种软件可以用于基于SNP数据构建系统发育树,例如MEGA、IQ-TREE、Phylip、FastTree和RAxML等。每种软件都有其特点和优势,你可以...