建议最短的话也要150bp,100的话如果万一引物不是很好或测的不好就很有可能出不来。反正我设计的时候最短尽量都控制在150 LZ有可能的话最好在那个位点前后3-400bp的地方设计引物,那样的话测出来后那个位点大概会在峰图的中间(一次测序大概能测出800个有效的碱基),准确度可以得到很好的保证,只要你引物没有问题。哈哈本人才疏学浅,以上意见仅供LZ参考,...
使用一个循环来迭代处理每个变异位点,调用get_seq函数获取变异位点附近的参考序列信息,并将结果保存在filter_snp$out列中。 filter_snp$out <- NA for (i in 1:nrow(filter_snp)) { seq_head <- get_seq( filter_snp$CHROM[i], as.numeric(as.numeric(filter_snp$POS[i]) - 100), as.numeric(as....
10. 迭代获取参考序列信息 使用一个循环来迭代处理每个变异位点,调用get_seq函数获取变异位点附近的参考序列信息,并将结果保存在filter_snp$out列中。 filter_snp$out <- NAfor (i in 1:nrow(filter_snp)) {seq_head <- get_seq(filter_snp$CHROM[i],as.numeric(as.numeric(filter_snp$POS[i]) - 100...