smart-seq特点 smart-seq特点 smart-seq特点：① 高灵敏度：能够检测到细胞中低丰度的转录本。比如在一些稀有细胞类型中，有一些基因的表达量非常低，普通的测序技术可能难以捕捉到这些微弱的信号，但smart-seq凭借其高灵敏度，就可以精准识别并对这些低表达基因进行测序分析，这使得我们对细胞内复杂的基因表达调控
Smart-seq2技术在单细胞水平对带Poly(A)的RNA进行全长转录组扩增及高通量测序,能够满足高灵敏度、低偏好性的cDNA扩增,得到全长转录本,实现高水平的序列模板转换。 Smart-seq2技术有较好的覆盖范围,可检测到稀有转录本,无需额外的专业设备,应用范围较广,可以解决传统 RNA 定量技术在早期胚胎发育、干细胞、癌症、...
1.Smart-Seq技术的迭代更新Smart-Seq技术为什么说Smart-seq(Switching mechanism at 5’ end of the RNA transcript)是可以测更多的基因呢?Smart-seq其实是可以对单个细胞RNA的基因亚型、等位基因等进行大规模测序,并检测mRNA全长的一种单细胞转录组测序技术,它由美国和瑞典科学家共同开发。这种能够从单细胞生成全长...
单细胞测序技术近年来成为生命科学领域的研究热点,其中Smart-seq技术因其高灵敏度和准确性备受关注。本文将深入解析Smart-seq技术的核心原理、迭代升级及其在科研中的应用价值。一、Smart-seq技术的发展与迭代Smart-seq技术最早由Ramsköld团队于2012年提出,旨在解决传统测序技术无法在单细胞水平解析...
Smart-seq2是一种单细胞RNA测序技术,用于分析单个细胞的基因表达情况,并可以对单个细胞的基因表达进行分析。 2、基本原理 Smart-seq2利用了莫罗尼小鼠白血病病毒逆转录酶(MMLV-RT)的两个特性: 该逆转录酶在合成到cDNA的3’端时会随机引入几个不依赖于模板的碱基,多数情况下是三个胞嘧啶。 逆转录酶是RNA指导的DNA...
SMART-seq样本要求 类型: 新鲜组织,原代细胞,细胞系等。 来源: 血液提取、磁珠富集、流式富集、组织解离等。 样本量: 单个细胞(或微量细胞)。 保存运输: 细胞放入 SMART-seq 试剂盒指定的裂解液中,-80°C 保存,干冰运输。
Smart-seq2 单细胞转录组测序通过 SMART 扩增技术对单个细胞中的 mRNA 进行逆转录和 PCR 扩增,结合转座酶建库技术,最终使用高通量测序手段,对单细胞中 mRNA 进行基因表达定量、功能富集、代谢通路等分析。它可以解决传统 RNA 定量技术在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在的样品量极低或细胞异质性的...
COVIDSeq Assay (96 samples) Illumina DNA Prep Illumina RNA Prep with Enrichment NextSeq 1000 & 2000 Sequencing Systems TruSight Oncology Product Family All Popular Products Do more, faster than ever Deeper studies, more samples, more modalities. The NovaSeq X and 25B flow cell make ultra-high ...
在Smart-seq分析流程里，文库构建是关键步骤，利用特殊的引物设计，能够特异性地富集全长cDNA，使得后续测序可全面覆盖转录本信息，进而准确分析基因的表达量与可变剪接情况。针对Smart-seq产出的数据，会运用严格的质量控制措施，例如过滤低质量reads、去除测序接头等，确保数据的可靠性与准确性，像Phred质量分数低于20的...
Smart-seq2技术于2013年被发表于《Nature Methods》,在Smart-seq技术基础之上,通过使用一种模板切换引物探针(TSO)并将其3'末端最后一个鸟苷酸替换为锁核酸(locked nucleic acid,LNA),结合更高浓度的Mg2+和甜菜碱,提高扩增精准度的同时产量也跟得上,只需要50 pg级别的RNA即可满足构建测序文库的需求,同时通过改善MM...