Smart-seq2建库流程 优缺点 优点: 以全长mRNA建库,对转录本覆盖度很高,能够知道每个外显子的表达量,甚至可以获取转录本剪接的信息 (号称)50pg RNA起始建库 提高了可mapping reads的比例,因为较少存在Drop-seq那种空液滴,无细胞的情况 mRNA sequence does not have to be known(?我觉得没有几种大规模测序需要...
丁香通:技术解读|单细胞转录组:Smart-seq 2还是10X Genomics Chromium?
而Smart-seq2技术则在gene上有着更为均一的分布。同时， 10x技术数据在splicing分析层面并不适用。
另外,可以明显发现基于全长测序方案的 Smart-seq 较 UMI,外显子区域的 reads 更多,其中 smart-seq2 有 48% 的 reads 比对到外显子区域(如下图)。这表明 Smart-seq2(48% reads 比对到外显子)和 Smart-seq(30% reads 比对到外显子)较 UMI 方案(均低于 15% reads 比对到外显子)有更好的测序质量。
缺点: 1. 并非链特异的。 2. 转录本长度偏向性,对超过4 Kb的序列不能高效转录。 3. 高丰度转录本被优先扩增。 4. 纯化步骤可能导致材料损失。 Smart-Seq2 Smart-Seq2一年后发表在《Nature Methods》上,对最初的Smart-Seq方案做了一些改进。新方案使用锁核酸(LNA)、更高浓度的MgCl2以及甜菜碱。它不再需要...
缺点 不稳定,低水平表达的转录组可能丢失。 转录本长度偏向性,对超过4Kb的序列不能高效转录。 并非链特异的。 价格较高。 Smart-seq2 Smart-seq2是经Smart-seq改进的一种测序方法,也目前最常用的单细胞转录组技术之一。 Smart-seq2 通过设计oligo(dT)VN Primer作为逆转录引物,利用MMLVRT的模板转换活性,在cDNA的...
4.1.2基于多核SoC的NIC 基于多核SoC的NIC使用大量嵌入式CPU内核来处理数据包,以某种性能进行交易以提供比ASIC设计更好的可编程性。这些设计在10GbE NIC一代中得到了广泛使用。有些像Cavium [13]使用通用CPU内核(MIPS,后来的ARM64),而另一些像Netronome [14]和Tilera则具有用于网络处理的特定内核。在这个领域中,...
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C. seq(6, times=6) D. seq(6, times=6) 查看完整题目与答案 在自由基聚合中,链自由基向单体转移使聚合速率增大。() A. 正确 B. 错误 查看完整题目与答案 明清小说里面,通常较少提到的肉是()。 A. 牛肉 B. 猪肉 C. 鱼肉 D. 鸡肉 查看完整题目与答案 城市规划作为一项社会...
缺点:耗电量大,且占用手机 Wi-Fi 通道。 蓝牙 优点:低功耗、低成本,且连接方便。 缺点:速度较慢、信号范围较小。 由于蓝牙突出的低功耗特性,且完全满足呼啦圈这类运动设备的数据传输和距离要求。我们选择蓝牙作为设备连接手机 App 的连接方式,选用涂鸦智能自主研发的低功耗蓝牙模组作为核心控制器。 选择液晶屏 液晶...