结果发现,Smart-seq2 敏感度最好,达到中位数 9138/cell,而最低的是 Drop-seq 和 MARS-seq,分别约为 4811/cell 和 4763/cell。 多个细胞进行实验时的敏感度对比 图.不同数量的细胞进行微量细胞建库时基因检出情况对比 多个细胞建库后的reads合在一起进行生信分析,结果发现,Smart-seq2 仍然具有更多的基因被检测...
结果发现,Smart-seq2 敏感度最好,达到中位数 9138/cell,而最低的是 Drop-seq 和 MARS-seq,分别约为 4811/cell 和 4763/cell。 多个细胞进行实验时的敏感度对比 图.不同数量的细胞进行微量细胞建库时基因检出情况对比 多个细胞建库后的reads合在一起进行生信分析,结果发现,Smart-seq2 仍然具有更多的基因被检测...
Smart-seq2作为单细胞转录组技术中的明星，确保了从单个细胞乃至极少量细胞中成功构建转录组建库的关键。传统的多细胞测序技术因其平均取样，容易丢失细胞间的异质性信息。而Smart-seq2通过独特的MMLVRT、TSO引物和甜菜碱/海藻糖添加技术，解决了这一问题。Smart-seq2技术基于MMLV的链置换和末端转移酶活性...
Smart-seq2技术有较好的覆盖范围,可检测到稀有转录本,无需额外的专业设备,应用范围较广,可以解决传统 RNA 定量技术在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在的样品量极低或细胞异质性的问题,是在单细胞水平研究基因表达强有力的...
Smart-seq2的方案组分和原理是公开的,让研究人员可以进一步对其进行改良,目前在这个方案基础上涌现了许多单细胞测序的新成果 限制 由于对聚腺苷酸化的RNA具有选择性,所以不能分析非poly(A)的RNA 测序reads不带有mRNA链特异性 建库技术原理 我们了解了Smart-seq2的优点和限制,到底怎样的文库结构和实验建库原理使它有...
总之,RNA-seq允许在正常和处理过程中对转录组进行高通量的检测,揭示样品间整体转录组水平的动态变化。 本文将简单介绍RNA-Seq建库策略--Smart-seq2的基本原理 smart-seq2流程.png 1.收集细胞 将细胞处理后(胚胎需去除透明带),置于含有RNA酶抑制剂的细胞裂解中,如果不立即进行实验需置于-80℃保存。(细胞处理过程尽...
Smart-seq2技术对于样本量少、特殊样本(比如生殖细胞)有较好的适配性。 技术流程: 分析流程: 样本要求: 真核生物(动物),mRNA 具有Poly(A)结构; 单细胞:细胞直径大于10μm; 微量细胞:细胞数目在200个以下; 微量total RNA:一般要求 RNA 28S/18S≥1,RIN≥7,浓度>50pg/μL。 建库测序: 测序策略:Ill...
寻标宝于2024-11-12发布西北农林科技大学4个羊smart-seq2建库测序分析,项目位于陕西省,项目编号null,招标单位西北农林科技大学,中标单位深圳市易基因科技有限公司。寻标宝为您提供陕西省2024年最新的招标采购信息查询服务。
中标单位: 深圳市易基因科技有限公司 中标金额: 5200元 发布时间: 2024-11-12 相关产品: 4个羊smart-seq2建库测序分析 更新时间:2024-11-03 联系方式共1条 金妙函未知 正文内容 2西北农林科技大学4 个羊smart-seq2 建库测序 分析 采购单位 动物科技学院 采购人 金妙函 成交供应商 深圳市易基因科技有...
基本上所有看起来高大上的技术都是建立在许多不怎么高大上的技术之上的,例如SMART-seq2扩增全长Cdna应该在SMART(switching mechanism at the 5' end of the RNA transcript)技术的基础上进一步发展实现的,当然并不否认SMART-seq的发现团队还是做了很多其他改进的。由于本文只关注SMART-seq2建库过程中的模板转换反应...