从测序数据随机抽取250万paired-end reads进行生物学信息分析。 Panel B.比较这两个试剂盒在总RNA以 50 pg起始制备文库的转录表达水平 (见Panel A), SMART-Seq Stranded Kit (Pearson =0.97)的再现性高于Pico v2 (pearson =0.92)。 图4. 不同起始量样本的高重现性 利用FACS分离出A375细胞,分别以1-1,000个...
SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc) 和SMART-Seq Single Cell PLUS Kit (SSsc PLUS) 是Takara科学家专门研发推出的两款具有高灵敏度和高可再现性的试剂盒,适用于单细胞和单个细胞核的RNA-Seq分析。试剂盒采用oligo(dT)引物,可从一些RNA含量非常低的单细胞(如PBMC, T细胞,B细胞)直接起始,并完成全长cDNA的捕获。
本试剂同样采用了领先的SMART-Seq v4 技术,结合了SMART (SwitchingMechanismat 5’ End ofRNATemplate) 技术和LNA (Locked Nucleic Acid) 技术。 本试剂除了侧重于mRNA转录本3’端外,还包含了内嵌的indexes作为Read2的细胞barcode,可以实现在每个测序lane中高达12个样品的pool,进一步缩减了时间和研究成本。本试剂可以...
SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc) 和SMART-Seq Single Cell PLUS Kit (SSsc PLUS) 是Takara科学家专门研发推出的两款具有高灵敏度和高可再现性的试剂盒,适用于单细胞和单个细胞核的RNA-Seq分析。试剂盒采用oligo(dT)引物,可从一些RNA含量非常低的单细胞(如PBMC, T细胞,B细胞)直接起始,并完成全长cDNA的捕获。
SMART-Seq®单细胞试剂盒技术的几个优点 与现有的用于制备scRNA-seq样品的技术相比,SSsc有几个优点。这包括优越的灵敏度和重复性;一个简单的、模板化的工作流;以及不受小型化影响的强劲性能。 考虑到SSsc的灵敏性和重复性,Takara的研究人员已经证明SSsc比广泛使用的Smart-seq2技术检测到更多的淋巴母细胞系 (GM128...
1、类型:新鲜组织,原代细胞,细胞系等。 2、来源:血液提取、磁珠富集、流式富集、组织解离等。 3、样本量:单个细胞(或微量细胞)。 4、保存运输:细胞放入 SMART-seq 试剂盒指定的裂解液中,-80°C 保存,干冰运输。
Takara公司拥有核心专利SMART技术,在2011年即推出了可以高灵敏度在单细胞水平上分析差异表达、融合基因、可变剪接,并提供全长信息的cDNA制备试剂。而升级的SMART-Seq HT Kit不仅做到操作时间大大缩短,而且可以检测到比以往更多的基因。 简单又靠谱的单细胞转录组建库试剂盒,了解一下 ...
SMART-seq样本要求 类型: 新鲜组织,原代细胞,细胞系等。 来源: 血液提取、磁珠富集、流式富集、组织解离等。 样本量: 单个细胞(或微量细胞)。 保存运输: 细胞放入 SMART-seq 试剂盒指定的裂解液中,-80°C 保存,干冰运输。
SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)是一款具有高灵敏度和低偏差的小鼠TCR NGS文库构建试剂盒。该试剂盒整合SMART(Switching Mechanism at 5' end of RNA Template)全长cDNA合成技术与5’RACE技术,可捕获TRA和TRB基因完整的V(D)J可变区,用于后续NGS分析。
Smart-seq因为以全长mRNA建库,所以对转录本的测序覆盖度也有所上升。2014年“升级换代”成SMART-seq2后,成为几乎每个单细胞测序公司都使用过的方法,直到现在还有许多厂商在制造SMART-seq2的试剂盒。 建库原理 1、单细胞分选:Smart-seq使用流式细胞仪进行细胞分选,...