在SLURM中,可以使用作业数组array来并行提交多个类似的任务。 #SBATCH --array=1-50 表示创建一个从1到50的作业数组,每个任务对应一个不同的输入文件。 $SLURM_ARRAY_TASK_ID 是SLURM提供的环境变量,代表当前任务的索引。 一个例子: #!/bin/bash #SBATCH --array=1-50 #SBATCH -N 1 #
问Slurm:最大SLURM_ARRAY_TASK_ID的变量EN我有一个简单的slurm作业文件，如下所示： 在实际的生...
如上所述:SLURM_ARRAY_TASK_ID 基本上是文件名 1 和 2 的 ls 输出的行号,其中对于 SLURM_ARRAY_TASK_ID,前两个文件名将为“1”。这允许集群上的并行化。 我怎样才能循环执行此操作?我遇到的问题是上面的方法可以工作,但只能在 25 个文件的数组上工作。服务器无法处理 90 的数组。这就是为什么 for 循环更...
#SBATCH --mem=8G # 定义任务脚本 TASK_SCRIPT="task.sh" # 获取当前任务实例的ID TASK_ID=${SLURM_ARRAY_TASK_ID} # 执行任务脚本 srun ${TASK_SCRIPT} ${TASK_ID} 在上述示例中,SBATCH脚本定义了一个名为"array_job"的作业,使用"--array=1-10"选项指定了一个包含10个任务实例的数组任务。每个任务...
SLURM_ARRAY_JOB_ID 当前组数作业的ID号码 SLURM_ARRAY_TASK_ID 当前数组作业的任务ID号 SLURM_ARRAY_TASK_COUNT 当前数组作业的任务总数 SLURM_ARRAY_TASK_MAX 当前数组作业的最大任务ID号 SLURM_ARRAY_TASK_MIN 当前数组作业的最小任务ID号 SLURM_ARRAY_TASK_STEP ...
SLURM_ARRAY_TASK_ID 该作业在数组中的索引。 SLURM_ARRAY_TASK_COUNT 作业数组中作业总数。 SLURM_ARRAY_TASK_MAX 作业数组中最后一个作业的索引。 SLURM_ARRAY_TASK_MIN 作业数组中第一个作业的做引。 可用以上变量来区分不同组内的任务,以便于处理不同的输入参数。
我想用$SLURM_ARRAY_TASK_ID=0,1,2运行3个并行任务。当单个任务完成时,例如srun ./my_program1.exe 0完成后,我想启动srun ./my_program1 浏览132提问于2021-10-11得票数 0 3回答 如何在slurm作业(从srun开始)完全完成之前保持脚本? 、 我使用SLURM运行一个作业数组,并使用下面的作业数组脚本(我是用sbatch...
#!/usr/bin/env bash #SBATCH -a 1-1936 sed -n ${SLURM_ARRAY_TASK_ID}p joblist_file | parallel --halt soon,fail=1 --retries 3 exit $? 哪个有效,但我觉得可能有更好的方法? 哪个有效,但我觉得可能有更好的方法? arrays slurm ...
创建脚本 array.slurm #!/bin/bash #SBATCH -J array #SBATCH -p compute #SBATCH -N 1 input=(foo bar baz) echo "This is job #${SLURM_ARRAY_JOB_ID}, with parameter ${input[$SLURM_ARRAY_TASK_ID]}" echo "There are ${SLURM_ARRAY_TASK_COUNT} task(s) in the array." ...
SLURM_ARRAY_JOB_ID如果此作业是作业数组的一部分,则将其设置为作业ID。否则将无法设置。要引用作业数组的此特定任务,请将SLURM_ARRAY_JOB_ID与SLURM_ARRAY_TASK_ID结合使用(例如“scontrol update $ {SLURM_ARRAY_JOB_ID} _ {$ SLURM_ARRAY_TASK_ID} ...”);仅适用于PrologSlurmctld和EpilogSlurmctld。